针对您提出的“擅自使用未经验收的工程如何计算工程款”的问题，这实际上涉及到一个复杂的法律与工程实践相结合的场景。首先，需要明确的是，建筑工程未经验收擅自使用是违法行为，这一行为将带来一系列严重的法律后果，包括但不限于丧失质量异议权、面临行政处罚、存在安全隐患以及可能的刑事责任。
关于工程款计算的问题
在正常情况下，工程款的计算是基于工程合同、工程进度、工程质量以及验收结果等多个因素来综合确定的。然而，当工程未经验收就被擅自使用时，工程款的计算就变得复杂且充满法律风险。
合同条款的审查：
- 首先，需要仔细审查工程合同中关于验收、付款以及违约责任的条款。合同中可能明确规定了未经验收擅自使用工程的后果，包括工程款支付的条件和方式。
法律后果的考量：
- 根据《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释（一）》等相关法律规定，若建设单位擅自使用未经验收的工程，并随后以质量问题为由主张权利，法院将不予支持（但地基基础工程和主体结构质量问题除外）。这意味着，在擅自使用后，建设单位可能难以以质量问题为由拒付或扣减工程款。
实际完成工程量的评估：
- 尽管工程未经验收，但如果需要计算工程款，可能还是需要对实际完成的工程量进行评估。这通常需要由专业的工程造价机构或第三方评估机构来进行，以确保评估结果的公正性和准确性。
协商与诉讼的途径：
- 在工程款计算存在争议的情况下，建设单位和施工单位应首先尝试通过协商来解决。如果协商无果，双方可以寻求法律途径，如提起诉讼或仲裁，来由法院或仲裁机构根据合同条款、法律规定以及实际完成情况来裁决工程款的支付。
综合建议
- 严格遵守法律法规：各相关方应充分认识到擅自使用未经验收工程的严重性和危害性，严格遵守相关法律法规和工程建设程序，确保工程经验收合格后再投入使用。
- 加强沟通与协作：在工程建设过程中，建设单位、施工单位和监理单位之间应加强沟通与协作，共同确保工程按期、按质完成验收工作，避免出现擅自使用的情况。
- 寻求专业法律帮助：在遇到工程款计算等法律问题时，各相关方可咨询专业律师或联系当地住建部门寻求帮助和指导，以确保自身权益得到保障。
综上所述，擅自使用未经验收的工程在计算工程款时面临诸多法律和实践上的难题。因此，各相关方应高度重视并采取有效措施加以防范和应对，确保工程建设的合法性和安全性。