施工单位质量罚款单应由建设单位或监理单位中具备相应权限的人员签发。具体分析如下：

一. 罚款单的签发主体

1. 建设单位：在工程项目中，建设单位通常负责项目的整体管理和监督，包括工程质量的把控。因此，建设单位有权对施工单位在工程质量方面的违规行为进行罚款，并由其内部具备相应权限的人员（如项目负责人、工程管理部门负责人等）签发罚款单。
2. 监理单位：监理单位受建设单位委托，对工程施工过程进行监理，确保工程质量符合设计要求和相关规范。监理单位在发现施工质量问题时，也有权根据监理合同的约定对施工单位进行罚款，并由监理单位内部具备相应权限的人员（如总监理工程师、专业监理工程师等）签发罚款单。

二. 相关法律依据

• 虽然具体法律法规中可能未直接规定罚款单由谁签发，但《中华人民共和国建筑法》、《建设工程质量管理条例》等法律法规明确了建设单位和监理单位在工程质量管理和监督方面的职责和权限。这些职责和权限包括但不限于对施工单位的质量行为进行监督和检查，以及在必要时采取包括罚款在内的措施来纠正违规行为。

三. 实际操作中的注意事项

• 在实际操作中，罚款单的签发应严格遵循相关法律法规和合同条款的规定，确保罚款行为的合法性和有效性。
• 罚款单应明确注明罚款的原因、金额、支付方式以及限期支付等要素，并送达给施工单位签收确认。
• 施工单位对罚款有异议的，有权按照合同约定的程序提出申诉或复议。

我建议在实际操作中，应明确建设单位和监理单位的职责和权限，确保罚款单的签发主体合法、合规。同时，施工单位也应加强对工程质量的管理和控制，避免违规行为的发生，以减少不必要的罚款。如有进一步需要，您可以继续咨询我。