关于“员工休息日加班，公司安排调休，员工不配合”这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析和解答：
结论前置
员工在休息日加班后，公司有权根据法律规定和实际情况安排调休。若员工不配合调休安排，公司应首先与员工进行沟通，明确调休的必要性和合法性。在沟通无果的情况下，公司可依据相关规章制度采取相应管理措施，但需注意遵守法律法规，避免侵犯员工合法权益。
法律分析
加班与调休的法律规定：
- 根据《劳动法》及相关规定，员工在休息日加班的，用人单位应安排补休或支付加班工资。这意味着，公司有权选择以调休的方式作为对休息日加班的补偿。
- 调休的具体安排需由用人单位与劳动者协商一致，并在劳动合同或相关规章制度中明确。
员工不配合调休的处理：
- 首先，公司应与员工进行充分沟通，解释调休的合理性、必要性以及具体安排，争取员工的理解和配合。
- 若员工仍不配合，公司可依据劳动合同或规章制度中的相关规定，采取如警告、扣罚绩效等管理措施。但需注意，这些措施应在合法合规的前提下进行，且不得侵犯员工的合法权益。
- 在极端情况下，若员工持续拒绝配合调休且严重影响公司正常运营，公司可考虑依据法律规定解除劳动合同。但此举需谨慎，需确保解除行为符合法律规定的条件和程序。
建议措施
- 完善规章制度：公司应确保劳动合同或规章制度中明确规定了加班与调休的相关条款，包括调休的安排、拒绝调休的处理等，为管理提供法律依据。
- 加强沟通协商：在安排调休时，公司应主动与员工进行沟通，了解员工的实际需求和困难，尽量满足员工的合理诉求，提高员工的配合度。
- 合规管理：在处理员工不配合调休的问题时，公司应遵守法律法规，确保管理行为的合法性和合规性，避免引发劳动争议。
综上所述，员工在休息日加班后，公司有权安排调休作为补偿。若员工不配合调休安排，公司应通过沟通、协商以及合规的管理措施来解决问题。如有进一步疑问或需要具体法律帮助，请直接向我咨询。