关于施工合同中约定不予计取安措费等费用是否有效的问题，我可以从以下几个角度进行分析：
核心结论
施工合同中约定不予计取安措费等费用，其有效性在司法实践中存在不同的裁判观点，并非绝对有效或无效。
分析说明
不可竞争费用的性质：
- 安措费（安全文明施工费）等费用通常被视为不可竞争费用，这些费用的目的是确保施工安全、保障工程合规合法，避免甲乙双方将这些费用作为交涉筹码。
- 各地方对于不可竞争费用都有相应的政策规定，对计取方式进行了约束。
司法实践中的不同裁判观点：
- 有案例认为，虽然施工合同中约定了不予计取安措费等费用，但考虑到这些费用是不可竞争费用，且工程质量合格，法院可能会支持在工程造价中计入这些费用。
- 也有案例认为，如果施工合同或招标文件中明确规定了安措费等费用的计取方式，承包人不得另行计算或主张。
法律法规的缺失：
- 现行法律、行政法规尚未明确规定不可竞争性费用禁止当事人约定下浮、不计取，因此当事人的该类约定并不必然因此无效。
实际法律后果：
- 即使施工合同中约定了不予计取安措费等费用，这并不等同于减免了施工企业缴纳这些费用的法定义务。
- 对于施工企业而言，这些费用是否由自己负责，还是可以另行向甲方主张，都要视具体案情来决定。
法律建议
鉴于施工合同中约定不予计取安措费等费用的有效性存在不确定性，我建议：
- 发包人和承包人在签订施工合同时，应尽量依法依规约定计取上述费用，避免因此产生纠纷。
- 施工企业应充分了解并遵守相关法律法规和政策规定，确保自身权益不受损害。
- 在发生纠纷时，应及时咨询专业律师，根据具体案情制定合适的应对策略。
如果您在施工合同纠纷或其他法律问题上需要进一步的帮助，请随时向我咨询。