即便厂子手续齐全，但若加工行为影响到了邻居的合法权益，邻居仍有权要求停止加工。针对这一问题，我们可以从以下几个方面进行分析：

一. 合法手续与相邻关系

1. 合法手续：你提到厂子手续齐全，这意味着你的厂子在设立和运营上符合了相关法律法规的要求，如工商注册、环保审批等。
2. 相邻关系：然而，即便手续齐全，也不能忽视与邻居之间的相邻关系。根据《民法典》的相关规定，不动产的相邻权利人应当按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，正确处理相邻关系。

二. 加工行为对邻居的影响

1. 影响评估：需要具体评估你的加工行为是否对邻居产生了不良影响，如噪音、污染、震动等。这些影响是否超出了邻居能够容忍的合理范围。
2. 法律依据：如果加工行为确实对邻居造成了不良影响，且超出了合理范围，那么根据《民法典》第二百九十四条，邻居有权要求你停止侵害、排除妨碍、赔偿损失。

三. 解决方案

1. 协商解决：首先，建议与邻居进行友好协商，了解他们的具体诉求，并尝试通过调整加工时间、采取降噪措施等方式来减轻对邻居的影响。
2. 法律途径：如果协商无果，邻居坚持要求停止加工，且你的加工行为确实存在不当之处，那么你可能需要考虑暂停加工或采取进一步的法律措施来解决问题。

我的观点：虽然你的厂子手续齐全，但相邻关系同样需要妥善处理。如果加工行为对邻居造成了不良影响，你应当积极采取措施予以解决。我建议首先尝试与邻居进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。如有必要，也可以考虑寻求法律援助或咨询相关部门以获取更具体的指导。如有进一步需要，您可以继续咨询我。