办理特殊经营许可时，邻居不签字通常不会直接影响许可的办理。但具体情况需根据相关法律法规及当地政策来判断，以下是对此问题的详细分析：

一. 一般情形下的处理

1. 无需邻居签字：根据《中华人民共和国公司法》第七条，依法设立的公司，由公司登记机关发给公司营业执照。这意味着，在一般情况下，办理营业执照或特殊经营许可时，并不需要邻居签字。

2. 与邻居沟通协商：尽管法律没有明确规定需要邻居签字，但为了维护良好的邻里关系，建议与邻居进行沟通，了解其不签字的原因，并尝试解决其担忧或问题。

二. 特定情形下的处理

1. 住宅改商用需邻居同意：根据《中华人民共和国民法典》第二百七十九条的规定，业主将住宅改变为经营性用房的，除遵守法律、法规以及管理规约外，应当经有利害关系的业主一致同意。这意味着，在将住宅改变为经营性用房并申请特殊经营许可时，如果邻居是有利害关系的业主，他们的签字同意是办理相关手续的重要一环。

2. 提供证明材料：如果邻居无理拒绝签字，您可以向工商行政部门或其他相关部门提供其他相关证明材料，如房产证、租赁合同等，以证明您的经营场所合法，并尝试说明邻居不签字的具体情况。

三. 法律途径

1. 寻求法律帮助：如果与邻居的协商无果，且邻居的拒绝签字影响了您的合法权益，您可以在法律范围内采取诉讼等法律手段解决。

2. 遵循法律规定：在整个过程中，务必遵循相关法律法规，确保自身行为合法合规，避免引发更大的法律纠纷。

我的观点是，在办理特殊经营许可时，邻居不签字通常不会构成直接障碍，但如果是将住宅改变为经营性用房的情况，则需要获得有利害关系的业主的同意。建议根据实际情况选择合适的处理方式，并在整个过程中保持冷静和理性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。