通过仲裁庭和解，公司补发的提成仍然需要扣税。

在劳动工伤（劳动仲裁）的情境中，当通过仲裁庭达成和解，公司同意补发提成时，这部分补发的提成属于员工的劳动收入，因此应当纳入个人所得税的征税范围。根据税法规定，个人所得税是对个人所得（包括工资、薪金、奖金、提成等）征收的一种税，所以补发的提成作为员工的收入，是需要依法缴纳个人所得税的。

具体来说，公司补发提成时，会按照税法规定扣除相应的个人所得税后，再将剩余部分发放给员工。这是公司作为扣缴义务人的法定职责，也是员工作为纳税人的法定义务。

因此，即使是通过仲裁庭和解获得的补发提成，也需要依法缴纳个人所得税。如果你对具体的扣税情况有疑问，建议咨询当地税务部门或专业税务机构，以获取更准确的解答。