假日加班工资不应扣除基本工资，而是应当在基本工资的基础上额外支付加班费。具体分析如下：

假日加班工资的基本构成

假日加班工资的计算是包含基本工资的，并且根据加班的类型和时间，会有不同的支付标准。基本工资是劳动者正常出勤时应得的工资，而加班费则是因劳动者在法定工作时间外提供劳动而应获得的额外报酬。

法定休假日加班工资

• 支付标准：根据《劳动法》第四十四条，法定休假日安排劳动者工作的，需支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。
• 具体解释：这里的“百分之三百工资报酬”是在劳动者当日基本工资的基础上额外支付的两倍工资作为加班报酬，总计为正常工资的三倍。即用人单位在法定休假日安排劳动者加班时，除正常支付当天工资（基本工资）外，还需额外支付两倍的基本工资作为加班报酬。

休息日加班工资

• 支付标准：休息日安排劳动者工作且不能安排补休的，需支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。
• 具体解释：这里的“百分之二百工资报酬”是单独作为加班工资支付的，不包含劳动者当日的基本工资。即用人单位在休息日安排劳动者加班且不能安排补休时，应支付两倍的基本工资作为加班工资。

举例说明

假设劳动者小张的日基本工资为200元：

• 在法定休假日加班一天，用人单位应支付600元（200元基本工资+400元加班报酬）。
• 在休息日加班一天且单位未安排补休，单位应支付400元加班工资（不包含当日基本工资）。

总结

综上所述，假日加班工资的计算需综合考虑基本工资和加班类型。法定休假日加班时，加班工资是在基本工资的基础上额外支付两倍工资；休息日加班且不能补休时，加班工资为正常基本工资的两倍。因此，假日加班工资不应扣除基本工资，而是应当在基本工资的基础上按照法定标准额外支付加班费。