即使公司工资通过微信转账给家人，劳动者依然可以申请劳动仲裁。但在申请劳动仲裁时，劳动者需要准备充分的证据材料来证明劳动关系的存在以及工资支付的情况。

证据收集

1. 微信转账记录：要清晰体现转账主体、用途为工资等关键信息。如果工资是转账给家人的，还需要提供证明该家人与劳动者的关系，以及为何工资会转账给家人的合理解释。
2. 劳动合同：这是确立劳动关系的重要凭证，必须提供。
3. 其他证明材料：如工作证、考勤记录、聊天记录等，这些都能辅助证明劳动关系的存在以及工资支付的情况。

申请流程

1. 撰写仲裁申请书：详细写明双方的信息，包括姓名、地址、联系方式等；明确仲裁请求，如要求支付拖欠工资、经济补偿等；阐述事实与理由，说明劳动纠纷的来龙去脉。
2. 提交申请材料：前往当地劳动仲裁委，提交仲裁申请书、收集好的证据材料以及本人身份证复印件。
3. 等待受理与开庭：提交材料后，等待仲裁委受理。受理后，仲裁委会安排开庭时间。庭审时，劳动者要清晰、有条理地阐述自己的诉求及事实依据。
4. 接受裁决：最后由仲裁委根据庭审情况作出裁决。

法律依据

• 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》的相关规定，用人单位违反国家规定，拖欠或者未足额支付劳动报酬的，劳动者可以向劳动行政部门投诉，也可以申请劳动仲裁。
• 同时，《中华人民共和国劳动合同法》也规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。如果用人单位拖欠或者未足额支付劳动报酬，劳动者可以依法向当地人民法院申请支付令，或者申请劳动仲裁。

综上所述，即使公司工资通过微信转账给家人，只要劳动者能够提供充分的证据材料证明劳动关系的存在以及工资支付的情况，就可以依法申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。