首先，单位想用职工车作为公车，但员工不配合处理，这是一个涉及单位内部管理和员工权益的问题。作为律师，我建议从以下几个方面来处理：

1. 明确法律关系和权益：

   • 要明确单位使用职工车作为公车的法律依据和员工的权益保护。单位是否有权使用职工车作为公车，需要查看单位的相关规定或劳动合同中是否有相关条款。员工不配合处理，可能是担心自己的权益受到侵害，比如车辆磨损、保险问题、责任划分等。

2. 沟通与协商：

   • 与不配合的员工进行坦诚沟通，了解其不配合的具体原因和顾虑。可以通过一对一的谈话，或者组织小型会议，让员工表达自己的想法和担忧。
   • 向员工解释单位使用职工车作为公车的必要性和合理性，以及这对员工可能带来的好处，比如提高工作效率、方便出行等。

3. 制定明确规则：

   • 制定关于职工车作为公车使用的详细规定，包括使用时间、范围、责任划分、保养维修等，确保员工的权益不受侵害。
   • 规定应经过员工同意或签署相关协议后，才能将职工车作为公车使用，确保程序的合法性和正当性。

4. 提供激励或补偿：

   • 对于配合使用的员工，可以给予一定的激励或补偿，比如提供车辆保养费用、加油补贴等，以增加员工的积极性和配合度。

5. 法律途径：

   • 如果经过沟通和协商，员工仍然不配合，单位可以依据相关规定或劳动合同中的条款，采取一定的管理措施，如警告、处罚等。
   • 在极端情况下，如果员工的拒绝配合导致单位无法正常运转或造成重大损失，单位可以依法追究其责任，但应谨慎使用法律手段，避免激化矛盾。

综上所述，处理这个问题需要从法律、沟通、规则制定和激励等多个方面综合考虑，确保既维护单位的正常运营，又保护员工的合法权益。如果你在这个过程中遇到任何具体的法律问题或需要进一步的法律咨询，可以直接向我提问，我擅长处理这类涉及单位内部管理和员工权益的法律问题。