员工多报销40万的费用，若涉及职务侵占或诈骗等犯罪行为，是有追溯期的。具体来说：

1. 追溯期的法律依据：

   • 根据我国《刑法》的相关规定，对于职务侵占罪、诈骗罪等犯罪行为，均有相应的追溯期限。这些追溯期限通常根据犯罪的严重程度和法定刑的高低来确定。

2. 追溯期的具体规定：

   • 职务侵占罪、诈骗罪等犯罪行为的追溯期限，一般根据《刑法》第八十七条的规定来确定。该条规定了不同法定刑对应的追溯期限，如法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年不再追诉；法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年不再追诉等。

3. 结合具体情况分析：

   • 员工多报销40万的费用，若构成职务侵占罪或诈骗罪，其追溯期限将依据上述法律规定来确定。具体追溯期限的长短，需要结合犯罪的具体情节、法定刑的高低以及是否有其他加重或减轻情节等因素来综合判断。

4. 法律建议：

   • 若员工存在多报销费用的行为，且涉嫌犯罪，建议尽快向公安机关报案，由公安机关依法进行侦查和处理。
   • 对于企业而言，应建立健全的财务管理制度和内部控制机制，加强对员工报销行为的审核和监督，防止类似行为的发生。

综上所述，员工多报销40万的费用是有追溯期的，具体追溯期限需要根据法律规定和犯罪的具体情况来确定。若有相关法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。