单位不按工资缴费基数交社保的合法性，需根据具体情况来判断。以下是对此问题的详细解答：
一、法律法规依据
- 《社会保险法》第十二条明确规定，用人单位应当按照国家规定的本单位职工工资总额的比例缴纳基本养老保险费。这意味着，社保缴纳基数应与职工的实际工资相符。
- 《社会保险费征缴暂行条例》第四条也要求缴费单位必须按时足额缴纳社会保险费，并需按月向社会保险经办机构申报应缴纳的社会保险费数额。
二、不同情况分析
基数低于实际工资：
- 如果用人单位为了降低用工成本，选择按低于员工实际工资的标准缴纳社保，这是不合法的。因为这样做损害了员工的合法权益，如养老金和医保个人账户的划入金额会受影响，同时用人单位也可能面临补缴、罚款等法律风险。
基数高于实际工资：
- 虽然这种情况较少见，但如果用人单位出于员工福利或税务筹划等原因，选择按高于员工实际工资的基数缴纳社保，这并不违反法律禁止性规定，且未损害员工权益。然而，用人单位需承担更高的社保费用成本。
特殊情况：
- 对于新员工入职首月或工资波动较大的员工，如计件工资或提成工资等，用人单位可能与员工协商一个相对固定的数来缴纳社保。这种情况下，虽然社保缴纳基数与实际工资不完全一致，但只要是双方协商一致的结果，并符合相关法律法规的规定，就是合法的。
三、应对措施
- 沟通协商：员工发现社保缴纳基数与实际工资不符时，应首先与用人单位进行沟通协商，要求其按照实际工资补缴社保差额。
- 法律途径：如果协商不成，员工可以向当地社保经办机构或劳动监察部门投诉举报，通过法律途径来维护自己的合法权益。
四、总结
综上所述，单位不按工资缴费基数交社保的合法性取决于具体情况。一般情况下，用人单位应按照职工实际工资确定社保缴纳基数，以确保员工的社保权益得到充分保障。在特殊情况下，用人单位应与员工协商并达成一致，确保社保缴纳的合法性和合理性。如果用人单位违反相关法律法规的规定，员工可以采取相应的应对措施来维护自己的权益。