认定虚开行为通常涉及税务稽查部门和经侦部门的共同协作，但初步的税务检查和证据收集主要由税务稽查部门负责，而深入的刑事侦查和犯罪打击则由经侦部门承担。以下是对这一问题的详细分析：

一、税务稽查部门的角色与职责

税务稽查部门是税务机关的重要组成部分，负责全面检查和监督纳税人、扣缴义务人的税务情况。在虚开增值税专用发票的案件中，税务稽查部门的主要任务包括：

1. 核查发票与业务的真实性：通过比对发票开具信息与企业实际经营业务，确保发票内容与实际交易相符，防止虚开行为。
2. 检查交易一致性：即资金流、票流、物流（以及可能的合同流）是否相互一致，这是判断交易真实性的重要依据。
3. 核查资金流向：检查企业银行账户流水，识别资金回流、虚假支付等异常资金流动，作为虚开行为的线索。
4. 分析税务数据：利用大数据分析系统，对企业的纳税申报数据、发票使用数据进行深入分析，发现异常指标和疑点。

税务稽查部门通过上述工作，为经侦部门提供初步的调查结果和证据支持，是认定虚开行为的重要一环。

二、经侦部门的角色与职责

经侦部门作为公安机关的重要力量，专注于经济犯罪案件的侦查工作。在虚开增值税专用发票案件中，经侦部门的主要职责包括：

1. 立案侦查：基于税务稽查部门移送的线索，对涉嫌虚开的案件进行正式立案，并运用刑事侦查手段收集证据，查明犯罪事实。
2. 调查购销关系：深入调查开票方与受票方之间的购销关系，确认是否存在真实的交易背景。
3. 搜查与扣押：对犯罪嫌疑人的住所、办公场所等进行搜查，扣押相关书证、物证，如增值税专用发票、印章、账册等。
4. 讯问犯罪嫌疑人：通过讯问获取犯罪嫌疑人的供述，查清案情细节，包括犯罪动机、时间、金额等关键信息。

经侦部门在认定虚开行为时，会综合考虑主观故意、交易真实性、发票开具与使用的合规性以及其他相关因素，并依据相关法律法规作出判断。

三、税务稽查与经侦部门的协作关系

在虚开增值税专用发票案件的查处过程中，税务稽查部门和经侦部门紧密合作，相互支持。税务稽查部门凭借其专业的税务知识和丰富的检查经验，首先对虚开行为进行初步调查和认定，为经侦部门提供线索和证据。经侦部门则利用刑事侦查手段，对案件进行深入侦查，查明犯罪事实，追究犯罪嫌疑人的刑事责任。

四、法律依据

• 《中华人民共和国刑法》第二百零五条：明确规定了虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的行为构成犯罪，并详细列举了虚开的具体情形。
• 《中华人民共和国发票管理办法》第二十一条：规定了开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并明确了虚开发票的具体行为。

总结与建议：

认定虚开行为是一个复杂的过程，需要税务稽查部门和经侦部门的共同努力和密切配合。如果您或您身边的人涉及此类案件，建议积极配合相关部门的调查工作，并寻求专业法律帮助以确保自身权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。