员工在工厂上班期间突发疾病，是否有赔偿主要取决于疾病是否被认定为工伤（包括职业病）以及企业是否为员工缴纳了相应的社会保险。以下是对此问题的全面分析：
一、工伤（职业病）情况
认定为工伤的情形：
- 条件：根据《工伤保险条例》第十五条，职工在工作时间和工作岗位上突发疾病死亡，或在48小时内经抢救无效死亡，视同工伤。此外，若疾病与工作存在因果关系（如工作环境、工作强度等诱发或加重原有疾病），且通过相关鉴定，也可能被认定为工伤或职业病。
- 认定流程：单位应在事故伤害发生之日或被诊断为职业病之日起30日内向社保行政部门提出工伤认定申请；特殊情况可适当延长。若单位未按时申请，工伤职工或其近亲属、工会组织可在一年内直接向社保行政部门提出申请。
- 赔偿项目：
- 医疗费用：包括治疗费、康复费等，由工伤保险基金支付。
- 停工留薪期工资：停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由单位按月支付。
- 伤残津贴：经劳动能力鉴定有伤残等级的，从工伤保险基金按等级支付一次性伤残补助金，并由用人单位安排工作或发放伤残津贴。
- 生活护理费：需要生活护理的工伤职工，从工伤保险基金按月支付生活护理费。
- 丧葬补助金与供养亲属抚恤金：若职工在工作时间和工作岗位上突发疾病死亡，或48小时内经抢救无效死亡，其家属可享受丧葬补助金和供养亲属抚恤金。
企业责任：
- 若企业未参加工伤保险，所有费用由企业按工伤保险待遇标准支付。
二、非工伤情况
医疗保险报销：
- 若疾病未被认定为工伤，但企业为员工缴纳了医疗保险，医疗费用可按规定报销。
医疗期与病假工资：
- 员工享有医疗期，根据工作年限给予三个月到二十四个月的医疗期。
- 医疗期内，企业应支付不低于当地最低工资标准80%的病假工资或疾病救济费。
经济补偿：
- 医疗期满后，若员工不能从事原工作也不能从事另行安排的工作，企业可解除劳动合同，并支付经济补偿。经济补偿按工作年限计算，每满一年支付一个月工资，额外情况按规定处理。
其他费用：
- 员工可向企业请求支付治疗和康复的合理费用，如医疗费、护理费、交通费等，但需符合相关规定和合同约定。
三、特殊情况与注意事项
用人单位过错责任：
- 如果用人单位存在过错，如未提供必要的劳动保护条件导致职工突发疾病，职工可通过民事诉讼要求用人单位承担赔偿责任。此时，职工需举证证明用人单位的过错与自身疾病之间存在因果关系。
及时报告与保留证据：
- 员工或其家属在突发疾病后应及时向单位报告，并妥善保存相关医疗证明、死亡证明等文件，以便后续办理赔偿手续。
了解自身权益：
- 员工应了解自己的权益和赔偿标准，及时与用人单位沟通协商，必要时通过法律途径维护自己的合法权益。
总结与建议：
员工在工厂上班期间突发疾病，是否有赔偿需根据具体情况判断。若疾病被认定为工伤或职业病，员工将享受全面的工伤保险待遇；若非工伤，则依据医疗保险、劳动合同法等获得相应补偿和救助。在任何情况下，员工都应了解自己的权益和赔偿标准，及时与用人单位沟通协商，并保留好相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。