结论前置：劳动合同不在自己手里时，你依然有权申请劳动仲裁，但需要采取一些措施来证明劳动关系的存在，并尽可能获取劳动合同文本或相关证据。以下是具体的分析和建议：
一、法律背景与规定
根据《中华人民共和国劳动合同法》第十六条的规定，劳动合同由用人单位与劳动者协商一致，并经双方在劳动合同文本上签字或者盖章生效。劳动合同文本应由用人单位和劳动者各执一份。这意味着，你作为劳动者，有权持有一份已签订的劳动合同。若用人单位未将劳动合同交付给你，不仅违反了法律规定，还可能给你在劳动纠纷中带来不利影响。
二、应对措施与建议
与用人单位沟通协商
- 主动询问：首先，你可以主动向公司的人力资源部门或相关负责人询问劳动合同的存放情况，并要求提供一份给你。
- 表达诉求：在沟通过程中，明确告知公司你需要持有劳动合同以维护自身权益，希望公司能够配合解决。
- 保留沟通记录：无论是面对面交流、电话沟通还是通过电子邮件、即时通讯工具，都应保留相关证据，以备后续可能出现的纠纷。
采取法律手段获取证据
- 向劳动监察部门投诉：若用人单位拒绝提供劳动合同或无法给出合理解释，你可以向当地的劳动保障监察机构（如人力资源和社会保障局）投诉。劳动保障监察机构会依法对用人单位进行调查处理，并可能要求用人单位提供劳动合同给你。在投诉时，你需要提供能证明劳动关系存在的材料，如工作证、工资支付记录、考勤记录等。
- 申请劳动仲裁：若投诉未能解决问题，或者你希望直接通过法律途径解决，你可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在仲裁过程中，你需要提供相关证据来证明自己与用人单位存在劳动关系。这些证据可以包括但不限于工作证、工资条、考勤记录、同事证言等。仲裁委员会会根据事实和法律规定作出裁决，要求用人单位提供劳动合同或承担相应的法律责任。
在仲裁中如何应对
- 提交其他证据：即使没有劳动合同，你依然可以通过提交其他证据来证明劳动关系的存在。例如，你可以提供工资支付记录、社保缴纳记录、工作证、考勤记录等，这些都可以作为证明劳动关系的有效证据。
- 申请仲裁委调查取证：在仲裁过程中，如果某些证据由用人单位掌握而你无法获取，你可以申请仲裁委员会要求用人单位提供。根据《劳动争议调解仲裁法》的规定，仲裁委员会有权要求用人单位在指定期限内提供相关证据，否则将承担不利后果。
三、注意事项
- 保留证据：在整个过程中，你应尽可能保留与用人单位沟通的记录、工作证、工资条等相关证据，以备不时之需。
- 了解时效：劳动争议的仲裁时效一般为一年，从你知道或者应当知道你的权利被侵害之日起计算。因此，你应及时采取行动维护自己的权益。
- 寻求专业帮助：如果你在仲裁过程中遇到困难或需要专业法律建议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更具体的法律支持和指导。
四、可能的法律后果
- 如果用人单位未将劳动合同交付给你，且经劳动监察部门或仲裁委员会责令改正后仍不改正的，用人单位可能会面临行政处罚或承担赔偿责任。
- 在仲裁过程中，如果用人单位无法提供劳动合同或其他有效证据来反驳你的主张，仲裁委员会可能会认定你与用人单位存在劳动关系，并支持你的仲裁请求。
综上所述，即使劳动合同不在自己手里，你依然有权申请劳动仲裁并维护自己的合法权益。关键在于你要采取积极的措施来证明劳动关系的存在，并尽可能获取劳动合同文本或相关证据。如果你在这个过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。