公司调休的合法性需根据具体情况判断，主要取决于调休的安排是否遵循了相关法律法规，特别是关于休息日加班和法定休假日加班的处理方式，以及是否与劳动者进行了充分协商并保障了劳动者的合法权益。以下是对此问题的详细分析：
合法调休的情形
休息日加班后的调休
- 合法性依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，公司在休息日（通常是周六、周日）安排员工加班后，可以选择安排调休或者支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。因此，在休息日加班的情况下，公司安排调休是合法的。
- 实施要点：调休应当合理安排，确保员工能够真正享受到休息的权益。调休时间应当与加班时间相当，不能出现加班时间长而调休时间短的情况。如果公司长期安排员工在休息日加班但一直不安排调休也不支付加班工资，则属于违法行为。
符合法律规定的加班与调休
- 加班时间限制：根据《劳动法》规定，用人单位在保障劳动者身体健康的条件下，可延长工作时间，但每日不得超过三小时，每月不得超过三十六小时。若公司在法律允许的加班时长范围内，因生产经营需要安排员工加班，并在之后的工作日中安排同等时间的补休（即调休），这通常是合法的。
- 规章制度与协商：公司规章制度中应明确规定调休的条件、程序等，且该规章制度需通过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并向劳动者公示或告知。调休安排应事先与劳动者进行沟通协商，确保双方就调休时间、方式等达成一致意见。
不合法调休的情形
法定休假日加班后的调休
- 合法性依据：同样根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，法定休假日（如元旦、春节等）安排劳动者工作的，必须支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。这意味着，在法定休假日加班的情况下，公司不能通过调休来代替支付加班工资。
- 特别说明：法定休假日加班支付300%工资是法律的强制性规定，旨在保障劳动者在法定节假日的休息权和获得相应劳动报酬的权利。因此，公司在法定休假日安排加班后仅进行调休而不支付相应加班工资是不合法的。
违反法定加班时间限制或未经协商的调休
- 加班时间超限：若公司长期让员工处于加班状态，累计加班时间远超法定上限，且未依法支付足额加班工资，这种调休安排是不合法的。
- 未经协商的调休：公司未与工会或员工协商，单方面频繁调休，打乱员工正常生活节奏和休息安排，这种做法也是违法的。
调休安排不符合劳动规章制度
- 规章制度缺失或违规：若公司未按照已公示的规章制度所规定的调休条件、程序进行调休，如拖延调休时间等，也是不合法的。
劳动者的权益保护与建议
- 沟通协商：若公司的调休安排侵犯了劳动者的合法权益，劳动者有权与公司进行沟通协商，表达自己的诉求和关切。
- 投诉与仲裁：协商不成的，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。在投诉或仲裁时，劳动者应提供相关证据，如加班记录、调休通知等，以支持自己的主张。
- 解除劳动合同：在某些情况下，如公司长期违法调休且拒不改正，劳动者甚至有权单方面解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿金。
综上所述，公司调休的合法性是一个综合考量的问题，涉及法律法规的遵守、双方协商一致以及劳动者权益的保护等多个方面。只有在严格遵守相关法律法规、充分尊重劳动者权益的基础上，公司的调休安排才能被视为合法有效。如果你对公司的调休安排有疑问或不满，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。