企业制定管理条例辞退员工是否合法，需根据具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 合法辞退的情况

   • 员工存在严重过错：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，若员工严重违反劳动纪律、企业规章制度或给用人单位造成重大损害，如严重失职、营私舞弊，或者同时与其他用人单位建立劳动关系对完成本单位工作任务造成严重影响，甚至被依法追究刑事责任等，企业有权依据管理条例（规章制度）解除劳动合同，且无需支付经济补偿。例如，员工多次违反企业明确规定的考勤制度，且情节严重，企业可以依据管理条例辞退该员工。
   • 协商一致辞退：若企业与员工就辞退事宜达成一致，并签订了协商解除劳动合同协议，这种情况下即使主要依据的是双方协商，而非严格的企业管理条例，辞退也是合法有效的。协议中应明确双方的权利和义务，包括经济补偿等相关事项。

2. 不合法辞退的情况

   • 缺乏法定事由：如果员工不存在严重违纪等法定可以解除劳动合同的情形，企业仅依据自身制定的管理条例随意辞退员工，则可能属于违法解除劳动合同。例如，员工偶尔迟到几分钟并未给企业生产经营带来重大影响，且企业管理条例中未明确规定这种情况可辞退，企业却将其辞退，即为不合法。
   • 程序违法：劳动法律法规对用人单位辞退员工的程序有严格规定。企业需要遵循法定程序，如提前通知工会（如果企业有工会组织）、向员工说明辞退理由等。即使员工存在一定过错，但企业未遵循法定程序进行辞退，也会被认定为辞退行为不合法。例如，企业未提前通知工会就辞退了员工，即使员工存在严重违纪行为，该辞退行为也可能因程序违法而不合法。

3. 法律责任

   • 对于不合法的辞退行为，根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条，用人单位应依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。计算公式为：赔偿金 = 经济补偿 × 2 = （工作年限 × 月工资标准）× 2（其中，月工资标准为劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资）。

4. 实际应用与建议

   • 当员工认为企业的辞退行为不合法时，首先应与企业进行沟通协商，要求给出合理说明。
   • 协商不成的情况下，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
   • 企业应建立健全的规章制度，明确辞退员工的条件和程序，并确保这些规章制度符合法律法规的规定，以确保辞退行为的合法性和规范性。

综上所述，企业制定管理条例辞退员工是否合法，需根据员工是否存在严重过错、是否协商一致、是否缺乏法定事由以及程序是否合法等多个因素进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。