关于单位降低公积金缴存是否合法的问题，这主要取决于单位调整公积金缴存的具体情况以及是否符合相关政策法规的规定。以下是一些详细的分析和解答：

首先，我们需要明确的是，公积金的缴存比例和缴存基数都是有一定规定的。以深圳市为例，根据深圳市住房和建设局的相关政策，单位在一个公积金年度内（当年7月1日至次年6月30日）只能调整一次缴存比例，且缴存比例在5%至12%之间确定，取1%的整数倍。同时，单位和职工的缴存比例下限均为5%，上限均为12%，且一个单位只能确定一个缴存比例，单位部分和个人部分的缴存比例相同。

如果单位降低公积金缴存比例：

• 单位可以根据自身实际情况在规定的缴存比例下限和上限区间内自行选择合适的缴存比例。因此，如果单位原本的缴存比例高于5%，而它选择降低到5%或以上但低于原比例的某个值（仍在5%-12%的范围内），并且这种调整是在一个公积金年度内只进行一次，那么这种调整是合法的。
• 但是，如果单位未经员工同意，擅自将缴存比例降低到5%以下，或者在一个公积金年度内多次调整缴存比例，那么这种调整就是不合法的。

如果单位降低公积金缴存基数：

• 公积金缴存基数通常为职工本人上一年度月平均工资。单位不能随意降低职工的公积金缴存基数，特别是不能通过扣减职工工资（如年终奖）的方式来降低缴存基数。
• 如果单位确实需要调整缴存基数，它应该基于职工实际的上一年度月平均工资来进行调整，并且这种调整也应该在一个公积金年度内只进行一次。
• 如果单位故意扣减职工工资以降低公积金缴存基数，这种行为是违规违法的，职工有权向相关部门进行投诉和维权。

综上所述，单位降低公积金缴存是否合法，取决于它是否遵守了相关的政策法规规定。如果单位在调整公积金缴存比例或基数时，遵循了政策法规的规定，并且经过了合法的程序（如与员工协商、公示等），那么这种调整就是合法的。反之，如果单位违反了政策法规的规定，或者未经员工同意擅自进行调整，那么这种调整就是不合法的。

因此，如果您发现单位降低了您的公积金缴存比例或基数，并且您认为这种调整是不合法的，您可以向当地的住房公积金管理中心或相关部门进行咨询和投诉，以维护自己的合法权益。