企业降低员工工资，将降低的部分缴纳住房公积金，这一做法通常是不合法的。以下从几个方面进行详细分析：

1. 工资与住房公积金的缴纳基础：

   • 工资是员工因提供劳动而获得的报酬，是员工劳动价值的直接体现。根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位应当按照劳动合同的约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
   • 住房公积金的缴纳基数通常是员工上一年度的月平均工资，且有一定的上下限规定。用人单位和员工应当按照规定的比例共同缴纳住房公积金。

2. 降低工资以缴纳住房公积金的合法性分析：

   • 如果企业未经员工同意，单方面降低员工工资，并将降低的部分用于缴纳住房公积金，这实际上是对员工劳动报酬的非法剥夺。因为住房公积金的缴纳是基于员工的工资收入，而不是通过降低工资来“创造”缴纳基数。
   • 此外，即使企业与员工协商一致降低工资，但这种降低如果违反了法律法规的强制性规定（如最低工资标准），或者损害了员工的合法权益，那么这种降低也是无效的。

3. 可能的法律后果：

   • 如果企业采取这种做法，员工有权向劳动监察部门投诉，要求企业补发被降低的工资，并可能面临劳动监察部门的处罚。
   • 在极端情况下，如果企业的行为构成恶意拖欠工资或违反其他劳动法律法规，员工还可以通过法律途径追究企业的法律责任，包括要求企业支付经济补偿金或赔偿金等。

4. 建议与措施：

   • 对于员工而言，如果发现企业有降低工资以缴纳住房公积金的行为，首先应当与企业进行沟通协商，要求企业恢复原工资水平或提供合理的解释和补偿方案。
   • 如果沟通无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，寻求行政救济。同时，也可以考虑咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的维权途径。
   • 对于企业而言，应当遵守相关法律法规，不得擅自降低员工工资或采取其他非法手段来规避住房公积金的缴纳义务。如果确实需要调整工资或住房公积金缴纳方案，应当与员工进行充分协商，并确保调整方案合法合规。

综上所述，企业降低员工工资以缴纳住房公积金的做法通常是不合法的。员工在遇到这种情况时，应当积极维护自己的合法权益，必要时寻求法律帮助。如果你有进一步的法律问题或需要具体的法律建议，可以直接向我咨询。