中标人支付招标代理费的依据是一个综合考量多方面因素的结果，主要包括法律法规的规定、招标合同的约定、行业惯例与市场规则等。以下是对这些依据的详细阐述：
一、法律法规依据
《中华人民共和国招标投标法》：
- 该法确立了招标投标活动的基本原则，即公开、公平、公正和诚实信用。虽然它并未直接规定招标代理费由谁支付，但为招标代理服务费用的支付安排提供了法律框架。在符合法律规定和市场规则的前提下，招标人和中标人可以通过约定来确定支付方式。
《招标代理服务收费管理暂行办法》及后续修改文件：
- 最初，该办法规定招标代理服务费用应由招标人支付。但后续文件进行了修改，明确指出“招标代理服务费用应由招标人支付，招标人、招标代理机构与投标人另有约定的，从其约定。”这一修改为招标代理费由中标人支付提供了明确的政策依据。
《政府采购代理机构管理暂行办法》：
- 该办法规定代理费用可以由中标、成交供应商支付，也可由采购人支付。若由中标、成交供应商支付，则供应商报价应当包含代理费用。这进一步确认了中标人支付招标代理费的合法性。
《合同法》第65条：
- 该条款规定了“第三人代为履行制度”，即当事人可以约定由第三人向债权人履行债务。这为招标人与招标代理机构约定招标代理费由中标人支付提供了直接的法律依据。
二、招标合同约定
招标文件规定：
- 招标人在编制招标文件时，应明确规定招标代理费的支付方式、金额及时间等关键条款。如果招标文件规定由中标人支付，那么中标人在参与投标时就应知晓并接受这一条件。一旦中标，中标人就有义务按照招标文件的规定支付招标代理费。
委托代理合同约定：
- 招标人与招标代理机构签订的委托代理合同中，也可能约定由中标人支付招标代理费。这种约定是双方真实意思的表示，只要不违反法律法规的强制性规定，对各方当事人都具有约束力。
三、行业惯例与市场规则
行业通行做法：
- 在某些行业或领域，由中标人支付招标代理费已经成为一种通行的做法，并被广泛接受和认可。这种行业惯例为中标人支付招标代理费提供了一定的实践依据。
市场竞争因素：
- 在市场竞争激烈的情况下，中标人可能为了获得中标机会，愿意承担招标代理费。这是中标人基于自身的商业考虑和市场策略做出的选择，也是市场规则发挥作用的体现。
四、实际操作中的注意事项
履行期限：
- 中标人支付的招标代理费履行期限应当在招标人与中标人签订书面合同后。若招标文件要求支付的时间点在签订书面合同前，甚至在发出中标通知书前要求支付，这是不合法的。
收费标准：
- 招标代理服务收费实行市场调节价，双方应参考相关标准，并以实际服务的内容、质量要求、市场供需和物价变化为定价基础，结合招标项目规模、工程等级、技术难易程度以及服务深度等确定代理服务费额度。
总结
中标人支付招标代理费的依据是多方面的，包括法律法规的规定、招标合同的约定、行业惯例与市场规则等。在实际操作中，应确保这些约定和规定符合法律法规的要求，以避免潜在的纠纷和风险。同时，招标人和中标人应充分沟通并达成一致，确保招标代理费的支付方式、金额及时间等关键条款明确无误。