关于教育机构合同中“超过三天不退费”条款的合法性，需要分情况讨论，不能一概而论。以下是我从不同角度为你进行的分析：

1. 合同条款的效力问题：

   • 合法有效的情况：如果教育机构在合同中明确写明了“超过三天不退费”的条款，并且该条款在签订时已经以显著方式（如加粗、加黑、单独提示等）提醒消费者注意，同时消费者也明确表示同意（如签字确认），那么该条款在法律上可能是有效的。这是因为合同是双方自愿达成的协议，只要不违反法律、行政法规的强制性规定，就是合法有效的。
   • 可能无效的情况：如果教育机构没有以显著方式提醒消费者注意该条款，或者消费者在签订合同时并不知情（如被误导、欺诈等），那么该条款可能因违反公平、诚实信用等原则而被认定为无效。此外，如果该条款明显加重了消费者的责任，排除了消费者的主要权利，也可能被认定为无效。

2. 消费者权益保护的角度：

   • 根据《消费者权益保护法》的相关规定，消费者在购买商品或接受服务时享有知情权、选择权、公平交易权等权利。如果教育机构在合同中设置“超过三天不退费”的条款，实际上是在限制消费者的退费权利，这可能侵犯了消费者的公平交易权。
   • 如果消费者因为教育机构的原因（如教学质量不佳、师资不符等）想要退费，而教育机构却以合同中的该条款为由拒绝退费，那么消费者可以通过法律途径维护自己的权益，如向消费者协会投诉、向法院起诉等。

3. 实际操作中的建议：

   • 签订合同前：消费者在签订教育机构合同时，一定要仔细阅读合同条款，特别是关于退费、违约责任等方面的条款。如果发现有不合理或不清楚的地方，要及时向教育机构提出询问或要求修改。
   • 签订合同后：如果消费者已经签订了含有“超过三天不退费”条款的合同，但后来因为某些原因想要退费，可以尝试与教育机构协商解决。如果协商无果，可以考虑通过法律途径维护自己的权益。

总结来说，教育机构合同中“超过三天不退费”的条款是否合法，取决于该条款的签订过程、内容以及是否违反了相关法律法规和消费者权益保护的原则。如果你遇到了类似的问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供更详细的法律建议。