国企员工休病假超过三个月，并不一定会被解除劳动合同。这一问题的答案取决于多个因素，包括员工的病情、医疗期、劳动合同的约定以及国企的规章制度等。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
医疗期规定：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。
- 在医疗期内，国企不得解除劳动合同，除非员工存在严重违反规章制度、严重失职等法定解除情形。
劳动合同约定：
- 劳动合同是员工与国企之间约定双方权利和义务的法律文件。如果劳动合同中明确规定了病假期限和解除劳动合同的条件，那么双方应遵守这些约定。
- 如果劳动合同中没有明确规定，或者规定与法律法规相冲突，那么应依据法律法规来处理。
国企规章制度：
- 国企可能根据自身情况制定了内部规章制度，包括病假管理、劳动合同解除等。这些规章制度在符合法律法规的前提下，对员工具有约束力。
- 如果国企的规章制度中规定了病假超过一定期限可以解除劳动合同，但这一规定与法律法规相冲突，或者未经过民主程序制定、未公示告知员工，那么这一规定可能无效。
病情与医疗期满后的处理：
- 如果员工医疗期满后仍不能从事原工作，也不能从事由国企另行安排的工作，国企可以提前三十日以书面形式通知员工本人或者额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。
- 在解除劳动合同前，国企应按照法律法规的规定支付经济补偿金，并办理相关手续。
法律建议：
- 对于员工而言，如果因病需要休病假，应及时向国企提交医疗证明，并按照规定办理病假手续。同时，应关注自己的医疗期期限，以及劳动合同和国企规章制度中关于病假和解除劳动合同的规定。
- 对于国企而言，应制定合法合规的病假管理制度和劳动合同解除制度，并确保这些制度经过民主程序制定、公示告知员工。在处理员工病假和解除劳动合同时，应严格遵守法律法规的规定，避免引发劳动争议。
可能后果：
- 如果国企在医疗期内违法解除劳动合同，员工有权要求继续履行劳动合同或者要求国企支付赔偿金。
- 如果员工医疗期满后仍不能从事工作，且国企未按照规定解除劳动合同或支付经济补偿金，员工也有权通过法律途径维护自己的权益。
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