公司关门时员工赔偿金的计算，主要依据《劳动合同法》的相关规定，结合员工的工作年限、工资水平以及公司关闭的具体原因来综合确定。以下是具体分析：
经济补偿金的基本计算
- 根据《劳动合同法》第四十七条，经济补偿金按员工在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向员工支付半个月工资的经济补偿。
- 月工资是指员工在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴等货币性收入。若员工月工资高于公司所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
公司关闭的不同情形及赔偿
- 合法关闭（如破产清算、解散等）：在这种情况下，公司需按照上述经济补偿金的标准向员工支付赔偿。若公司无法立即支付，可能需通过破产清算程序，按照法定顺序清偿债务，其中包括员工的经济补偿金。
- 违法关闭（如未经法定程序擅自关闭）：若公司未经法定程序擅自关闭，可能构成违法解除劳动合同。根据《劳动合同法》第八十七条，公司需按照经济补偿金标准的二倍向员工支付赔偿金。
特殊情况的考虑
- 员工患病或非因工负伤：若员工在医疗期内，公司关闭导致劳动合同终止的，除支付经济补偿金外，还需按照国家有关规定支付医疗补助费。
- 女职工在孕期、产期、哺乳期：若公司关闭时，女职工处于孕期、产期、哺乳期的，公司除支付经济补偿金外，还需按照国家有关规定给予特殊保护，如支付额外的生育津贴等（具体依据地方性法规）。
实际操作建议
- 收集证据：员工应保留好劳动合同、工资条、工作证等证明劳动关系和工资水平的证据。
- 协商解决：在公司关闭初期，员工可与公司协商赔偿事宜，争取达成一致意见。
- 申请劳动仲裁：若协商无果，员工可向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
总结：公司关门时员工的赔偿金主要依据《劳动合同法》的规定计算，包括经济补偿金和可能的赔偿金。具体数额需根据员工的工作年限、工资水平以及公司关闭的具体原因来确定。若遇到特殊情况，如员工患病、女职工在孕期等，还需按照国家有关规定给予特殊保护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。