结论概述：店长私自罚款员工，员工申请劳动仲裁能获得的赔偿金额并非固定，而是取决于罚款的合法性、员工因此遭受的实际损失以及相关证据的充分性。以下从多个角度进行详细分析。
一、罚款的合法性分析
公司规章制度：
- 根据《劳动合同法》及相关法律法规，公司有权制定规章制度，但这些制度必须合法、合理，且经过民主程序制定并公示。若店长私自罚款的行为未依据合法有效的公司规章制度，则该罚款行为可能被视为违法。
罚款的合理性：
- 即使公司规章制度中有关于罚款的规定，罚款的金额也应当合理，不能过分高于员工因违规行为所造成的损失。若罚款金额明显不合理，员工有权在劳动仲裁中提出异议。
二、员工实际损失的计算
直接经济损失：
- 员工因店长私自罚款而遭受的直接经济损失，即被罚款的金额，是计算赔偿的基础。若员工能提供充分的证据证明罚款事实及金额，这部分损失通常应得到全额赔偿。
间接经济损失：
- 若罚款行为导致员工产生其他间接经济损失，如因罚款导致的精神损害、误工费等，员工也有权在劳动仲裁中提出赔偿请求。但这类损失的赔偿通常需要员工提供充分的证据证明其与罚款行为之间的因果关系。
三、劳动仲裁中的赔偿计算
赔偿范围：
- 在劳动仲裁中，员工可以请求赔偿因店长私自罚款而遭受的全部经济损失，包括直接经济损失和间接经济损失。
赔偿金额的确定：
- 赔偿金额的具体数额将由劳动仲裁委员会根据双方提供的证据和实际情况进行裁决。若员工能提供充分的证据证明其损失，且罚款行为被认定为违法或不合理，则员工有可能获得全额赔偿。
- 计算公式示例（假设仅考虑直接经济损失）：
- 赔偿金额 = 被罚款金额
- 若员工被罚款500元，且能提供充分证据证明该罚款行为违法或不合理，则赔偿金额可能为500元。
特殊情况：
- 若罚款行为虽然违法或不合理，但员工未能提供充分证据证明其损失，或者损失金额难以确定，劳动仲裁委员会可能会根据实际情况酌情裁决赔偿金额。
四、法律建议
收集证据：
- 员工应尽快收集与罚款行为相关的证据，如罚款通知、工资条、银行转账记录等，以证明罚款事实及金额。
咨询专业律师：
- 在申请劳动仲裁前，员工可以咨询专业律师，了解自身权益和可能的赔偿金额，以便更好地准备仲裁材料。
提起劳动仲裁：
- 员工在收集到充分证据后，可以向当地劳动仲裁委员会提起劳动仲裁申请，请求赔偿因店长私自罚款而遭受的损失。
五、可能面临的法律后果
- 若劳动仲裁委员会裁决店长（或公司）需赔偿员工损失，店长（或公司）应履行裁决义务。若拒不履行，员工可以向人民法院申请强制执行。
- 若店长私自罚款的行为构成违法或犯罪（如职务侵占等），店长还可能面临行政处罚或刑事责任。
总结与启示：店长私自罚款员工的行为可能违法或不合理，员工有权通过劳动仲裁途径寻求赔偿。赔偿金额的具体数额将取决于罚款的合法性、员工实际损失以及相关证据的充分性。因此，员工在遭遇此类情况时，应尽快收集证据并咨询专业律师，以便更好地维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。