针对您月薪5000元且被鉴定为九级工伤，伤愈后仍在公司上班的情况，赔偿金额主要包含一次性伤残补助金等项目，具体计算如下：
一次性伤残补助金
- 计算依据：根据《工伤保险条例》第三十七条，九级伤残的一次性伤残补助金为9个月的本人工资。
- 具体计算：您的月工资为5000元，因此一次性伤残补助金为 \(5000元/月 \times 9月 = 45000元\)。
一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金
- 说明：这两项补助金的具体标准由省、自治区、直辖市人民政府规定，因此会因地区而异。
- 一般情况：虽然无法给出确切数额，但通常这两项补助金会合计为一定月数的本人工资。以某地区为例，假设两项合计为10个月本人工资（仅为示例，实际需依据当地政策），则总额为 \(5000元/月 \times 10月 = 50000元\)。您需要查阅当地的工伤保险条例或咨询当地社保部门以获取准确数额。
停工留薪期工资
- 说明：在停工留薪期内，您的原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
- 具体计算：停工留薪期的长度根据伤情和医疗机构建议确定，一般不超过12个月。若您停工留薪期为X个月（X≤12），则停工留薪期工资为 \(5000元/月 \times X月\)。
其他可能赔偿
- 护理费：如果伤情需要护理，根据护理级别和当地护工市场行情确定护理费。
- 住院伙食补助费：按当地规定的标准支付，如每日30元，乘以住院天数。
- 医疗费、康复费等：符合工伤保险诊疗项目目录、药品目录、住院服务标准的，从工伤保险基金支付。
赔偿流程与注意事项：
- 工伤认定：确保事故发生后30日内，单位已向社会保险行政部门提出工伤认定申请。若单位未申请，您或您的近亲属、工会组织可在1年内自行申请。
- 劳动能力鉴定：伤情稳定后，向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出申请，确定伤残等级。
- 计算赔偿：根据伤残等级和相关政策规定，计算应得赔偿金额。
- 获取赔偿：若单位缴纳工伤保险，部分赔偿由工伤保险基金支付；若未缴纳，则全部由单位承担。与单位协商赔偿事宜，协商不成可申请劳动仲裁或提起诉讼。
特别提醒：
- 由于一次性工伤医疗补助金和一次性伤残就业补助金的具体标准因地区而异，您需要查阅当地的工伤保险条例或咨询当地社保部门以获取准确数额。
- 停工留薪期的长度也需根据您的具体伤情和医疗机构建议确定。
- 若您在伤愈后继续在公司上班，不影响您享受上述工伤赔偿待遇。
总结与建议：
- 九级工伤的赔偿金额因多种因素而异，但一般包括一次性伤残补助金、一次性工伤医疗补助金、一次性伤残就业补助金以及其他可能的赔偿项目。
- 建议您在了解当地政策和计算方式的基础上，积极与单位沟通协商赔偿事宜。
- 若协商不成或遇到其他法律问题，欢迎直接向我咨询，我将为您提供专业的法律帮助。