结论：您从公安机关工勤岗位转至乡镇并担任综治办主任是否合法，需结合具体任职程序、编制性质及地方规定综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

一、从编制性质与岗位匹配性角度分析

1. 工勤编制与行政岗位的差异
   工勤编制通常属于事业单位编制，主要从事后勤服务、技术保障等工作，而综治办主任一般属于行政岗位，需具备公务员身份或行政编制。若您未通过公务员考试、调任程序或地方特殊政策（如工勤人员转岗政策）完成身份转换，直接担任行政岗位可能存在合规性风险。

2. 地方政策例外情形
   部分地区可能出台工勤人员转岗管理岗位的试点政策（如通过内部竞聘、考核等方式），但需满足以下条件：

   • 地方明确允许工勤人员转任管理岗；
     
   • 任职程序符合地方规定（如公示、审批等）；
     
   • 岗位性质与原编制职能不冲突。
     若您所在地区有此类政策且程序合规，则任职合法。

二、从任职程序合法性角度分析

1. 调任程序的合规性
   根据《公务员调任规定》，事业单位工勤人员调入机关担任领导职务需满足：

   • 具有与拟调任职位要求相当的工作经历和资历；
     
   • 具备公务员法及其配套法规规定的晋升至拟任职务累计所需的最低工作年限；
     
   • 调入机关有编制空缺且职务与岗位匹配。
     若未履行调任手续（如组织考察、审批等），直接任命可能违反程序规定。

2. 内部提拔的合规性
   若您通过乡镇内部提拔程序任职（如从工勤岗位竞聘管理岗），需符合：

   • 乡镇有明确的工勤人员转岗制度；
     
   • 提拔过程公开透明（如民主推荐、考核、公示）；
     
   • 岗位设置与编制管理文件一致。
     若程序存在瑕疵（如未公示、未报上级备案），可能面临任职无效风险。

三、从地方规定与实际执行角度分析

1. 地方性法规的特殊性
   部分省份可能出台基层治理相关政策，允许工勤人员在乡镇层面担任非领导职务或临时性管理岗位（如综治办主任），但需满足：

   • 岗位性质为“非领导职务”或“临时性岗位”；
     
   • 任职期限明确（如不超过一定年限）；
     
   • 地方党委或政府出具书面认可文件。
     若您符合此类规定，则任职合法。

2. 实际执行中的容错空间
   基层实践中，部分地区可能因工作需要（如综治工作专业性要求不高）放宽编制限制，但需注意：

   • 此类任职通常为“临时性”或“过渡性”；
     
   • 需尽快通过合法程序（如考录、调任）完善身份；
     
   • 若长期未解决编制问题，可能面临审计或纪律审查风险。

四、法律建议与风险提示

1. 核实任职依据
   建议您向乡镇政府或组织部门索要书面任职文件，重点核查：

   • 文件依据（如地方政策、内部规定）；
     
   • 审批流程（如是否报县级编制部门备案）；
     
   • 岗位性质（如是否明确为“管理岗”或“临时岗”）。

2. 完善身份转换手续
   若您希望长期担任该职务，建议通过以下途径合法化：

   • 参加公务员考试或事业单位公开招聘；
     
   • 申请调任（需满足公务员调任条件）；
     
   • 推动地方出台工勤人员转岗政策并依规办理。

3. 风险防范
   若任职程序存在瑕疵，可能面临：

   • 职务被撤销；
     
   • 工资福利停发；
     
   • 纪律处分（如违反编制管理规定）。
     建议尽快与组织部门沟通，补全手续或调整岗位。

总结：您当前任职的合法性需以地方政策、编制性质及任职程序为依据。若程序合规且地方允许，则合法；若存在程序瑕疵或编制冲突，则需尽快补正。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作路径。