结论：新入职员工25号开始上班，31号是周日公司全体休息，31号是否算工资，主要取决于公司的工资计算周期和考勤制度，但通常情况下，如果31号属于公司正常的休息日且员工没有实际出勤，则不计入工资；若公司有特殊规定或员工有加班等特殊情况，则可能计入工资。以下从不同角度详细分析：
公司工资计算周期和考勤制度：
- 大多数公司会按照固定的周期（如月、周）来计算工资，并依据考勤制度来确定员工的出勤情况。如果31号作为周日，是公司正常的休息日，且员工没有实际出勤，那么根据一般的考勤制度，这一天通常不会被计入工资计算周期内，因此不算工资。
- 但是，如果公司的工资计算周期或考勤制度有特殊规定，比如将休息日也纳入工资计算周期（尽管这种情况较为少见），或者员工在休息日有加班等特殊情况，那么31号就可能会计入工资。
劳动合同和公司规章制度：
- 劳动合同和公司规章制度是确定员工工资和福利待遇的重要依据。如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了休息日是否计入工资，那么应按照这些规定来执行。
- 如果劳动合同或公司规章制度中没有明确规定，那么可以参照行业惯例或相关法律法规来处理。在大多数情况下，休息日不计入工资是行业惯例。
特殊情况下的工资计算：
- 如果员工在31号（周日）有加班，那么根据《劳动法》的相关规定，员工有权获得加班费。加班费的具体计算方式取决于公司的加班政策和当地的法律法规。
- 另外，如果公司因为特殊原因（如业务繁忙、紧急任务等）要求员工在休息日工作，并且没有按照法律规定支付加班费，那么员工有权向公司提出异议，并要求公司按照法律规定支付相应的工资和加班费。
建议：
- 对于员工来说，如果对自己的工资计算有疑问，可以首先查阅自己的劳动合同和公司规章制度，了解公司的工资计算周期和考勤制度。
- 如果仍然有疑问或发现公司存在违法行为（如未支付加班费等），可以向公司的人力资源部门或相关负责人咨询，并要求公司给予明确的答复和合理的解释。
- 如果公司拒绝支付应得的工资或加班费，员工可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
示例：
假设某公司的工资计算周期为每月1日至月末，考勤制度规定休息日不计入工资。如果员工在25号入职，并在31号（周日）休息，那么根据公司的工资计算周期和考勤制度，31号不会计入该员工的工资计算周期内，因此不算工资。但如果该员工在31号加班，且公司按照法律规定支付了加班费，那么该员工在31号仍然可以获得相应的收入。