卫健部门确实有可能以证据不足为由不予立案。这一结论主要基于以下法律背景和程序要求：

1. 立案的法定条件

根据《行政处罚法》及相关卫生健康领域的法规（如《传染病防治法》《基本医疗卫生与健康促进法》等），卫健部门对涉嫌违法的案件立案需满足两个核心条件：

• 有初步证据证明违法行为存在：例如，举报材料、现场检查记录、监测数据等能指向特定主体实施了违反卫生法规的行为（如非法行医、污染饮用水等）。
• 属于本部门管辖范围：即违法行为需在卫健部门的职权范围内（如公共卫生、医疗机构监管等）。

若证据不足以证明违法行为存在（如仅有匿名举报但无其他佐证），或证据与违法行为无直接关联，卫健部门可依法作出不予立案决定。

2. 证据不足的具体情形

实践中，以下情况可能导致卫健部门以证据不足为由不予立案：

• 证据形式不合法：如举报人未提供身份证明、证据材料未加盖公章或签字等。
• 证据内容不充分：例如，仅提供“某诊所可能存在非法行医”的模糊表述，但无具体时间、地点、人员或诊疗记录等关键信息。
• 证据链断裂：如监测报告显示水质超标，但无法证明超标与特定企业的排污行为存在因果关系。
• 超过追诉时效：若违法行为发生时间已超过法定追诉期限（如《行政处罚法》规定的2年），即使证据充分也可能不予立案。

3. 当事人的救济途径

若对卫健部门的不予立案决定不服，当事人可通过以下方式维权：

• 申请复议：向上一级卫健部门或同级人民政府提出行政复议申请，要求重新审查立案决定。
• 提起诉讼：直接向法院提起行政诉讼，请求撤销不予立案决定并责令卫健部门履行立案职责。
• 补充证据：在复议或诉讼期间，若能补充新证据（如证人证言、监控录像等），可一并提交以支持主张。

4. 实务建议

• 举报时尽量提供详细证据：如现场照片、视频、书面合同、医疗记录等，避免仅凭口头陈述或推测。
• 关注卫健部门的反馈：若收到不予立案通知，可要求卫健部门书面说明理由，并核对证据是否确实不足。
• 及时咨询专业律师：若案件涉及复杂法律问题或证据收集困难，建议提前介入以制定维权策略。

总结：卫健部门是否立案需严格依据证据和法律程序，证据不足是合法的不立案理由之一。若当事人认为决定有误，可通过复议或诉讼途径寻求救济。如有具体案件需要分析，可直接向我咨询。