合同无效时，清算条款的有效性并非绝对，而是需要根据具体情况来判断。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 清算条款的独立性

• 法律依据：根据《中华人民共和国民法典》第五百零七条，合同不生效、无效、被撤销或者终止的，不影响合同中有关解决争议方法的条款的效力。清算条款，作为处理合同终止后相关事宜的重要部分，其性质往往与解决争议方法的条款相似，具有一定的独立性。
• 应用说明：清算条款旨在合理安排合同无效后的财产返还、损失赔偿等问题，有助于妥善处理后续事宜，维护交易的公平和秩序。因此，在合同无效的情况下，如果清算条款能够独立于合同其他部分存在，且其内容未受合同无效原因的影响，那么它们通常被视为有效。

2. 清算条款的合法性

• 法律要求：清算条款必须遵守法律、行政法规的强制性规定，不得损害国家利益、社会公共利益或第三人合法权益。
• 无效情形：如果清算条款本身存在违法情形，如涉及不公平的交易条件、欺诈、胁迫等，或者清算条款与合同无效的部分紧密相关、无法分割，那么该清算条款很可能也会被视为无效。

3. 清算条款与合同其他部分的关系

• 可分割性：如果清算条款与合同其他无效部分关系不密切，例如它们不是基于合同中的非法目的或违法行为而设立的，那么这些条款的有效性通常不受影响。
• 不可分割性：相反，如果清算条款与合同无效部分关系密切，或者清算条款的存在和执行依赖于合同其他有效部分，那么清算条款的有效性可能会受到质疑。

4. 实际案例说明

• 案例一：假设甲乙两公司签订了一份货物买卖合同，后因合同违法（如涉及走私）而被认定无效。但合同中约定了“合同无效时，双方应按照实际交付的货物和已支付的款项进行清算”的条款。由于该清算条款具有独立性，且未违反法律法规，因此它仍然有效，双方应按照该条款进行清算。
• 案例二：再假设甲乙两公司签订了一份合作协议，约定共同投资开发一个项目，并约定了利润分配和清算条款。后因甲公司欺诈导致合同无效。如果清算条款中包含了“甲公司无需承担任何损失”的不公平条款，那么该条款可能因显失公平而被认定无效。

5. 建议与注意事项

• 签订合同时：在签订合同时，务必审慎对待每一个条款，特别是清算条款。确保清算条款的合法性和有效性，以避免未来可能出现的纠纷和风险。
• 合同无效后：如果合同被认定无效，应及时咨询专业律师，对清算条款的有效性进行评估。根据评估结果，采取相应的法律措施来维护自己的合法权益。

总结来说，合同无效时清算条款的有效性取决于其独立性、合法性以及与合同其他部分的关系。在签订合同时，应充分考虑这些因素，确保清算条款的合法性和有效性。如果合同无效后涉及清算问题，建议及时咨询我，以便根据具体情况采取合适的法律措施。