结论：公司降低公积金缴费比例，同时冻结并抬高员工缴纳基数以保持员工缴纳总额不变的做法，其合法性需分情况讨论，但在多数情况下，这种做法可能涉嫌违法。
分析：
公积金缴费比例的法律规定：
- 根据《住房公积金管理条例》及相关规定，住房公积金的缴存比例由单位和个人根据实际情况自行选择，但不得低于一定比例（如5%），同时也有上限规定。单位和个人缴存的住房公积金比例应当相同，且原则上不得随意变更。
- 若公司未经员工同意或未按照法定程序，单方面降低公积金缴费比例，这可能违反了相关法律法规的规定。
缴纳基数的调整：
- 公积金的缴纳基数通常是员工上一年度的月平均工资。公司若未经员工同意，擅自调整缴纳基数（尤其是抬高基数以弥补降低比例带来的差额），可能缺乏合法依据。
- 缴纳基数的调整应当基于合理的理由，如员工工资的实际增长或下降，且需遵循相关法律法规和公积金管理中心的规定。
员工缴纳总额不变的情况：
- 即使公司试图通过抬高缴纳基数来保持员工缴纳总额不变，这种做法也可能因违反公积金缴存比例和基数的调整规定而无效。
- 公积金的缴存不仅关乎员工的个人利益，也涉及社会保障体系的稳定运行。因此，公司不能仅从自身利益出发，随意调整公积金的缴存方式。
可能的法律后果：
- 如果公司违反了公积金管理的相关法律法规，公积金管理中心有权对公司进行处罚，包括责令限期缴存、罚款等。
- 员工也有权向公积金管理中心投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
建议：
- 对于公司：应严格遵守公积金管理的相关法律法规，不得随意调整公积金的缴存比例和基数。如需调整，应提前与员工协商并征得同意，同时按照法定程序进行申报和审批。
- 对于员工：如发现公司存在违法调整公积金缴存比例和基数的行为，应及时向公积金管理中心投诉或寻求法律援助。同时，也可以与公司进行沟通协商，要求公司纠正违法行为。
额外思考：
- 在实际操作中，公积金的缴存比例和基数的调整可能因地区而异。因此，在判断公司行为的合法性时，还需结合当地的具体规定进行综合分析。
- 公积金作为员工的一项重要福利，其缴存情况直接影响到员工的切身利益。因此，无论是公司还是员工，都应高度重视公积金的缴存问题，确保合法合规。
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