医疗科室主任辞去职务，医院并非必须同意，但需根据具体情况和医院规章制度来处理。以下从不同角度进行分析：

1. 劳动合同与职务任免的区分：

   • 科室主任的职务通常与劳动合同相关联，但职务的任免并不完全等同于劳动合同的解除或变更。劳动合同主要规定了双方的基本权利和义务，如工作内容、工作地点、薪酬等。而职务的任免，特别是管理职务的任免，往往受到医院内部规章制度、管理架构以及相关法律法规的约束。
   • 如果科室主任的辞职仅涉及职务的变更，而不涉及劳动合同的解除或变更，那么医院在考虑是否同意时，会更多地依据其内部规章制度和管理需要。

2. 医院规章制度与程序：

   • 医院通常会有明确的规章制度来规定职务的任免程序。这些程序可能包括辞职申请的提交、审批流程、交接工作等。科室主任在辞职时，需要遵循这些程序。
   • 如果科室主任按照医院规章制度提交了辞职申请，并完成了必要的交接工作，那么医院在无正当理由的情况下，不应拒绝其辞职请求。然而，如果科室主任的辞职可能给医院带来重大损失或影响，医院可能会要求其继续履行职务或采取其他措施。

3. 法律法规的约束：

   • 在处理职务任免问题时，医院还需遵守相关法律法规，如《劳动法》、《劳动合同法》等。这些法律法规规定了劳动者和用人单位的基本权利和义务，以及劳动合同的解除和变更条件。
   • 如果科室主任的辞职符合法律法规的规定，且医院没有合理的理由拒绝，那么医院应当同意其辞职请求。否则，科室主任有权通过法律途径维护自己的权益。

4. 实际案例与操作建议：

   • 在实际操作中，科室主任辞职时，建议与医院进行充分沟通，明确辞职的原因、时间、交接工作等事项，并尽量达成书面协议。
   • 如果医院拒绝辞职请求，科室主任可以了解医院拒绝的具体原因，并评估这些原因是否合理合法。如果认为医院的拒绝行为侵犯了自己的权益，科室主任可以向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

总结与建议：

• 科室主任辞去职务时，医院并非必须同意，但需根据具体情况和医院规章制度来处理。
• 科室主任在辞职前应了解医院的规章制度和程序，并遵循这些规定提交辞职申请。
• 如果医院拒绝辞职请求，科室主任应评估拒绝的合理性，并考虑通过法律途径维护自己的权益。

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