结论：非耕地上建猪圈是否违法及如何处理，需根据土地性质、是否取得合法审批手续等因素综合判断。以下分情况详细说明：
一、若土地性质为宅基地或建设用地
合法情形：
- 若在宅基地或已依法转为建设用地的非耕地上建猪圈，且已取得《乡村建设规划许可证》或《农村宅基地批准书》等合法审批手续，则属于合法建设，不构成违法。
- 法律依据：根据《土地管理法》第六十二条，农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。经合法审批后，可在宅基地范围内建设附属设施（如猪圈）。
违法情形：
- 若未取得合法审批手续，擅自占用宅基地或建设用地建猪圈，可能面临责令限期拆除、恢复土地原状或罚款等行政处罚。
- 法律依据：根据《土地管理法》第七十七条，未经批准或者采取欺骗手段骗取批准，非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地，对违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状；对符合土地利用总体规划的，没收在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，可以并处罚款。
二、若土地性质为基本农田或一般耕地
违法情形：
- 无论是否取得审批手续，在基本农田或一般耕地上建猪圈均属于违法行为。基本农田是严格保护的耕地，不得擅自改变用途；一般耕地虽可经审批转为建设用地，但需符合土地利用总体规划和年度计划，并依法办理农用地转用审批手续。
- 法律依据：
- 根据《土地管理法》第三十五条，永久基本农田经依法划定后，任何单位和个人不得擅自占用或者改变其用途。
- 根据《土地管理法》第四十四条，建设占用土地，涉及农用地转为建设用地的，应当办理农用地转用审批手续。
处理方式：
- 若已建成猪圈，可能面临责令限期拆除、恢复土地原状、罚款等行政处罚；若拒不执行，还可能被申请法院强制执行。
- 建议：立即停止建设行为，主动向当地自然资源主管部门报告情况，争取从轻处理；若已建成，可咨询专业律师，评估是否可通过补办手续等方式合法化，或制定拆除、补偿等方案。
三、特殊情形：设施农业用地
合法情形：
- 若猪圈属于设施农业用地（如规模化养殖中的生产设施用地），且已按《自然资源部、农业农村部关于设施农业用地管理有关问题的通知》等规定办理备案手续，则属于合法建设。
- 要求：设施农业用地需符合土地利用总体规划和年度计划，不得占用永久基本农田（除非符合特定条件），且需签订用地协议并备案。
违法情形：
- 若未办理备案手续或擅自扩大用地规模、改变用途，则可能构成违法用地。
四、综合建议
- 核实土地性质：通过当地自然资源主管部门或村委会查询土地性质，确认是否为宅基地、建设用地或农用地。
- 检查审批手续：若土地性质允许建猪圈，需检查是否已取得合法审批手续；若未取得，应立即补办或停止建设。
- 咨询专业律师：若涉及复杂法律问题（如土地性质争议、行政处罚争议等），建议咨询专业律师，制定合法合规的解决方案。
总结：非耕地上建猪圈是否违法，关键在于土地性质和是否取得合法审批手续。若土地性质合法且手续齐全，则不构成违法；否则可能面临行政处罚。建议根据实际情况采取相应措施，并咨询专业律师以降低法律风险。