超容积率补交土地出让金引发的争议，既可能涉及行政诉讼，也可能涉及民事诉讼，具体取决于争议的性质和当事人的诉求。以下从不同角度进行分析：

1. 行政诉讼角度
   若开发商或土地使用权人认为行政机关（如自然资源部门）作出的“补交土地出让金决定”存在程序违法（如未依法听证、未告知救济权利）或实体违法（如容积率计算错误、出让金标准适用错误），可针对该行政行为提起行政诉讼，请求法院撤销或变更决定。
   关键点：行政诉讼的被告是行政机关，核心争议是行政行为的合法性。

2. 民事诉讼角度
   若争议源于开发商与业主、合作方之间的合同纠纷（如业主主张开发商因超容积率未披露导致权益受损，或合作方主张按约定分担出让金），则属于民事纠纷范畴，需通过民事诉讼解决。
   关键点：民事诉讼的双方是平等主体，核心争议是合同权利义务的履行或赔偿。

3. 特殊情形：行政协议纠纷
   若超容积率问题涉及政府与开发商签订的《国有建设用地使用权出让合同》（属于行政协议），且争议围绕合同履行（如政府要求补交出让金是否符合合同约定），则可能通过行政诉讼中的“行政协议”案由解决。
   关键点：需结合合同性质及争议内容判断，部分法院可能允许当事人选择行政或民事途径。

建议：

• 若争议针对行政机关的决定，优先选择行政诉讼；
  
• 若争议涉及合同关系，需根据合同性质选择民事或行政诉讼；
  
• 实践中可能存在交叉，建议携带具体材料（如决定书、合同）进一步分析。
  

如有具体案件细节，可直接向我咨询，我会结合证据和地方规定提供针对性方案。