结论：初核有违纪行为但不需要立案的情况下，可以主动登记上交款项。这一行为通常被视为对违纪行为的积极纠正，有助于减轻或避免可能的纪律处分。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律与纪律规定角度
违纪行为的处理原则：
- 在纪律审查中，对于初核发现的违纪行为，如果情节轻微，不需要追究党纪责任或给予纪律处分的，通常会采取批评教育、责令检查、诫勉等方式进行处理。
- 主动登记上交违纪所得款项，是违纪人员积极纠正错误、减轻处分影响的一种表现。
相关法规依据：
- 虽然具体的法规可能因地区和单位性质而有所不同，但一般纪律处分条例或相关规定中，都会鼓励违纪人员主动交代问题、上交违纪所得，以争取从轻或减轻处理。
- 例如，在《中国共产党纪律处分条例》等相关规定中，对于主动上交违纪所得的，可以视情节轻重给予从轻或减轻处分。
二、实际操作角度
主动登记上交的程序：
- 违纪人员应向所在单位或纪律审查机关如实说明违纪情况，并主动提出上交违纪所得款项的意愿。
- 单位或纪律审查机关会按照相关规定，对违纪所得进行登记、保管，并出具接收凭证。
上交款项的后续处理：
- 上交款项后，单位或纪律审查机关会根据违纪行为的性质、情节以及上交款项的情况，综合考虑是否给予纪律处分以及处分的种类。
- 如果违纪行为轻微，且主动上交款项，通常可以免予纪律处分或给予较轻的处分。
三、法律后果与风险防范
法律后果：
- 主动登记上交违纪所得款项，有助于减轻或避免纪律处分，对违纪人员的个人声誉和职业发展影响较小。
- 如果隐瞒不报或拒不上交，一旦被发现，将可能面临更严重的纪律处分，甚至可能涉及法律责任。
风险防范建议：
- 违纪人员应增强纪律意识，主动学习相关法规，了解违纪行为的后果。
- 在发现违纪行为后，应尽快向单位或纪律审查机关报告，并主动上交违纪所得款项，以争取从轻或减轻处理。
四、特殊情况考虑
- 如果违纪行为涉及更复杂的法律问题，如贪污、受贿等犯罪行为，即使初核不需要立案，也建议违纪人员咨询专业律师，了解更全面的法律后果和风险防范措施。
- 在某些情况下，主动登记上交款项可能只是违纪处理的一部分，违纪人员还需要配合单位或纪律审查机关的进一步调查和处理。
总结与建议：初核有违纪行为但不需要立案时，主动登记上交款项是一种积极纠正错误、减轻处分影响的行为。建议违纪人员增强纪律意识，主动学习相关法规，并在发现违纪行为后尽快向单位或纪律审查机关报告并上交款项。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。