结论：员工对劳动合同有异议但已签字且合同被公司收走的情况下，员工仍可以通过多种途径来维护自己的权益。

分析说明：

1. 合同异议的合法性：

   • 员工对劳动合同有异议，并不因为已经签字就失去提出异议的权利。劳动合同的签订应当基于双方自愿、平等、协商一致的原则，如果员工在签订时存在误解、被欺诈或胁迫等情况，或者合同内容存在违法、不公平等条款，员工完全有权提出异议。

2. 合同被收走的处理方式：

   • 尽管合同被公司收走，但员工仍可以采取措施来证明合同的存在及其内容。例如，员工可以尝试与公司沟通，要求复印或拍照留存合同副本；如果公司拒绝，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司提供合同副本或确认合同内容。
   • 在实际操作中，员工还可以收集其他与劳动合同相关的证据，如工作证、工资条、考勤记录等，这些证据可以在一定程度上证明员工与公司之间的劳动关系以及合同的实际履行情况。

3. 提出异议的具体途径：

   • 与公司协商：员工可以首先尝试与公司进行协商，表达自己对合同的异议，并寻求双方都能接受的解决方案。
   • 申请劳动仲裁：如果协商无果，员工可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求确认合同无效或变更合同内容。在申请劳动仲裁时，员工需要提供相关证据来支持自己的主张。
   • 提起诉讼：如果劳动仲裁结果不满意，员工还可以向法院提起诉讼，通过司法途径来维护自己的权益。

4. 注意事项：

   • 员工在提出异议时，应当注意保留相关证据，如沟通记录、邮件、短信等，以便在需要时提供证明。
   • 员工应当了解自己的权益和义务，避免在提出异议时因不了解法律而陷入被动。
   • 如果员工对法律程序不熟悉，可以寻求专业律师的帮助，以确保自己的权益得到充分维护。

行动建议：

• 收集证据：尽快收集与劳动合同相关的所有证据，包括工作证、工资条、考勤记录等，以及任何能证明你对合同有异议的沟通记录。
• 与公司沟通：尝试与公司进行友好沟通，表达你的异议，并寻求解决方案。如果公司愿意配合，可以协商复印或拍照留存合同副本。
• 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果沟通无果，你可以根据具体情况选择申请劳动仲裁或提起诉讼来维护自己的权益。在这个过程中，如果需要，可以寻求我的专业帮助。

法律背景：

• 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的签订应当遵循自愿、平等、协商一致的原则，任何一方不得强迫对方签订不公平或违法的合同。
• 如果员工对劳动合同有异议，可以通过合法途径提出，并寻求法律保护。劳动仲裁和诉讼是解决劳动争议的重要途径，员工可以根据自己的情况选择适合的方式来维护自己的权益。