结论：在耕地上建小仓库、小菜棚、看护房是否算非法占用，以及是否会被处罚，主要取决于是否符合相关法律法规的规定，特别是关于设施农业用地的管理规定。关于合法面积，也需依据具体规定来判断。

详细分析：

1. 非法占用的判定：

   • 根据《土地管理法》及相关规定，耕地主要用于农业生产，未经批准擅自改变用途用于非农业建设（如建设小仓库、小菜棚、看护房等），可能构成非法占用土地。
   • 但是，如果建设的小仓库、小菜棚、看护房等属于设施农业用地范畴，且符合当地设施农业用地管理规定，经过了相关部门的批准或备案，则不属于非法占用。设施农业用地通常包括直接用于作物种植和畜禽水产养殖的设施用地，如生产设施用地、附属设施用地等。

2. 是否会被处罚：

   • 如果未经批准擅自占用耕地建设非农业设施，且不符合设施农业用地管理规定，那么根据违法情节的轻重，可能会面临责令退还非法占用的土地、限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施、恢复土地原状，以及罚款等行政处罚。
   • 如果建设行为符合设施农业用地管理规定，且经过了相关部门的批准或备案，则不会受到处罚。

3. 合法面积的判断：

   • 合法面积主要依据当地设施农业用地管理规定来确定。不同地区可能根据土地资源状况、农业生产需求等因素，制定了不同的设施农业用地规模标准。
   • 一般来说，设施农业用地中的附属设施用地规模会受到严格控制，例如，有的地区规定附属设施用地规模原则上控制在项目用地规模一定比例以内（如5%以内），但具体比例可能因地区而异。
   • 因此，要确定合法面积，需要查阅并遵循当地的具体规定。

建议：

• 在建设小仓库、小菜棚、看护房等设施前，应先了解当地设施农业用地管理规定，确保建设行为符合规定要求。
• 如果需要占用耕地进行建设，应提前向相关部门申请批准或备案，避免非法占用土地的风险。
• 如果对具体规定或申请流程有疑问，可以向当地自然资源部门或农业部门咨询，以确保建设行为的合法性和合规性。

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