在耕地上建仓库，一般情况下属于违章建筑行为，但特定条件下经过法定程序审批后建设则是合法的。以下是对这一问题的详细分析：
一、通常情况下属于违章建筑
法律依据：
- 根据《土地管理法》及相关法律法规，我国实行严格的土地用途管制制度，耕地主要用于农业生产，未经批准不得擅自改变其用途。
- 禁止占用耕地建窑、建坟或者擅自在耕地上建房、挖砂、采石、采矿、取土等，破坏种植条件的行为，这同样适用于建仓库等非农业建设行为。
违规后果：
- 未经依法批准，擅自在耕地上建设仓库，违反了土地用途管制制度，通常会被相关部门认定为违法建筑。
- 面临限期拆除、恢复土地原状的处罚，并可能被处以罚款等行政处罚。
二、特殊情况下的合法性
农用地转用审批：
- 若建设者按照法定程序，向相关部门提出申请，并经过农用地转用审批手续以及其他必要的规划、建设审批，将耕地合法转变为建设用地，则在此土地上建设仓库不属于违建。
- 审批流程涉及多个层级和部门，包括永久基本农田转为建设用地的需由国务院批准，以及在土地利用总体规划确定的城市和村庄、集镇建设用地规模范围内，将永久基本农田以外的农用地转为建设用地的需按土地利用年度计划分批次批准等。
特殊项目需求：
- 因国家能源、交通、水利、军事设施等重点建设项目需要，经有批准权的人民政府批准后，可以将耕地转为建设用地用于建设相关的仓库或设施。这种情况下，建设行为是合法的。
农村地区特殊情况：
- 在农村地区，如果建设仓库是为了满足农村村民住宅、乡镇企业、乡村公共设施和公益事业等需求，且经依法批准使用本集体经济组织农民集体所有土地，并按照相关规定办理审批手续后，也可以在符合要求的土地上建设仓库。
三、建议与风险提示
咨询当地自然资源部门：
- 在决定是否在耕地上建设仓库前，务必咨询当地的自然资源部门，了解具体的政策和审批要求，以避免因违法建设而带来不必要的损失。
遵守法律法规：
- 严格遵守土地管理法律法规，不擅自改变土地用途，确保建设行为的合法性。
风险防范：
- 对于可能存在的法律风险，如政策变化、审批流程复杂等，应提前进行风险评估和应对准备。
总结来说，在耕地上建仓库的合法性取决于是否经过法定程序的审批和是否符合土地利用总体规划。未经批准擅自建设将面临严重的法律后果，因此建议建设单位或个人在决策前充分了解相关法律法规和政策要求，确保建设行为的合法性。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。