结论：请假超过3天按15天事假扣费是否正常，不能一概而论，这主要取决于公司的规章制度以及劳动合同中的相关约定。以下从不同角度进行分析：
公司规章制度角度：
- 如果公司的规章制度中明确规定了请假超过一定天数（如3天）后，将按照更长时间（如15天）的事假来扣费，并且这一规定已经通过合法程序（如职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定）制定并公示，那么公司按照这一规定执行是合法的。
- 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
劳动合同约定角度：
- 如果劳动合同中明确约定了请假超过3天后将按照15天事假扣费，且这一约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司按照劳动合同的约定执行也是合法的。
- 注意点：劳动合同中的约定应当公平合理，不得显失公平或违反法律法规的强制性规定。如果约定过于苛刻或不合理，劳动者有权提出异议并寻求法律救济。
合理性角度：
- 即使公司的规章制度或劳动合同中有相关规定，但如果这种扣费方式明显不合理，如扣费金额过高、扣费时间过长等，劳动者也可以与公司进行协商，要求调整扣费方式或金额。
- 建议：劳动者在遇到此类情况时，可以先与公司进行沟通协商，了解扣费的具体依据和原因。如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
总结与建议：
- 请假超过3天按15天事假扣费是否正常，需根据公司的规章制度和劳动合同中的相关约定来判断。
- 如果公司的规章制度或劳动合同中有明确规定，且该规定合法有效，那么公司按照这一规定执行是合法的。
- 如果劳动者认为扣费方式不合理或违反法律法规的强制性规定，可以与公司进行协商或寻求法律救济。
- 在处理此类问题时，建议劳动者保留好相关证据（如请假条、公司规章制度、劳动合同等），以便在需要时维护自己的合法权益。
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