请事假三天以上的工资扣除，通常是根据公司的具体规定和劳动合同来执行的，但总体上需要遵循国家的相关法律法规。以下是一般情况下事假扣工资的计算方式和注意事项：
计算方式：
按照每月固定计薪天数21.75天计算：
- 首先，根据《关于职工全年月平均工作时间和工资折算问题的通知》，月计薪天数确定为21.75天。
- 接着，计算日工资：日工资 = 月工资收入 ÷ 21.75天。
- 最后，根据事假天数计算扣款：事假扣款 = 日工资 × 事假天数。例如，如果员工月工资为6525元，日工资则为300元（6525 ÷ 21.75），若请3天事假，应扣工资为900元（300 × 3），以此类推，如果事假超过3天，则按照实际事假天数进行扣款。
按照当月实际计薪天数计算：
- 当月实际计薪天数 = 当月总天数 - 当月休息日天数（包括法定节假日）。
- 日工资 = 月工资收入 ÷ 当月实际计薪天数。
- 事假扣款同样按“日工资 × 事假天数”计算。
注意事项：
- 合法性：扣除方式必须符合国家法律法规，不能违反相关规定随意扣款。
- 公司规定与劳动合同：公司应有明确的事假工资扣除规定，并且这些规定应经过民主程序制定并向员工公示。同时，如果劳动合同中有关于事假工资扣除的特别约定，且该约定不违反法律法规，则应按合同约定执行。
- 最低工资保障：扣除事假工资后，员工的实际工资不得低于当地最低工资标准。如果扣除后的工资低于最低工资标准，则应按最低工资标准支付。
特殊情况处理：
- 如果员工在事假期间恰逢法定节假日或休息日，这些天数通常不计入事假天数进行扣款。
- 如果公司与员工就事假工资扣除存在争议，双方应首先尝试通过协商解决；协商不成时，可以依法向劳动争议仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼。
综上所述，事假三天以上的扣款方式主要根据公司的具体规定和劳动合同来执行，但必须遵循国家法律法规的相关规定。在扣款时，应确保合法、合理，并充分保障员工的合法权益。