自愿申请辞去副科级职务本身并不违规。这一行为主要涉及到个人职业选择和单位内部管理的问题，下面我将从不同角度为你详细分析：

1. 个人职业选择角度：

   • 公务员或事业单位人员有权根据自己的职业规划和发展需求，自愿申请辞去现有职务。这是个人职业自由的一种体现，只要符合单位的相关规定和程序，通常是被允许的。

2. 单位内部管理角度：

   • 单位对于员工的职务变动，包括辞职，通常会有相应的管理制度和流程。员工在申请辞职时，需要遵循这些制度和流程，如提前提交辞职申请、完成工作交接等。
   • 如果员工在辞职过程中违反了单位的规定或程序，如未提前通知、未完成工作交接等，单位可能会根据内部规定给予相应的处理，但这并不等同于辞职行为本身违规。

3. 法律法规角度：

   • 从法律法规层面来看，自愿申请辞去副科级职务并没有明确的禁止性规定。只要员工在辞职过程中没有违反法律法规或单位规定，其行为就是合法的。
   • 当然，如果员工在辞职后涉及到竞业限制、保密义务等特殊情况，需要遵守相应的法律法规和合同约定。

可能存在的特殊情况：

• 如果员工在辞职时涉及到单位的重要项目或关键任务，且未经单位同意擅自离职，可能会给单位造成损失。在这种情况下，单位可能会根据内部规定或法律法规追究员工的责任。但这并不改变辞职行为本身的合法性，而是对辞职后可能产生的后果进行处理。

建议：

• 如果你打算自愿申请辞去副科级职务，建议先了解单位的相关规定和程序，确保自己的辞职行为符合单位要求。
• 同时，也要考虑辞职后可能面临的职业发展和生活变化，做好充分的准备和规划。

如果你在辞职过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业、全面的法律服务。