结论：员工因突然离职导致非标自动化设备报废，是否需要赔偿需根据具体情况判断，主要涉及员工是否存在故意或重大过失、劳动合同或公司规章制度中的相关约定以及实际损失情况等因素。以下从不同角度进行分析：
一、员工责任认定
故意或重大过失：
- 如果员工在离职时明知其行为会导致设备报废，或者应当预见但因疏忽大意没有预见，或者已经预见但轻信能够避免，导致设备报废的，员工可能构成故意或重大过失。
- 在这种情况下，员工可能需要承担赔偿责任，赔偿范围通常限于公司因此遭受的实际损失。
一般过失或无过失：
- 如果员工离职时并无故意或重大过失，而是由于设备本身存在隐患、公司管理不善或其他非员工原因导致设备报废的，员工通常不需要承担赔偿责任。
二、劳动合同及公司规章制度
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确约定了员工在离职时需承担因个人原因导致公司财产损失的责任，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么员工可能需要按照合同约定进行赔偿。
公司规章制度：
- 如果公司规章制度中规定了员工离职时需遵守的程序和注意事项，以及因违反规定导致公司财产损失的责任承担方式，员工也可能需要按照规章制度进行赔偿。
- 但需要注意的是，公司规章制度需经过民主程序制定并公示，且内容不违反法律法规的强制性规定，才能对员工产生约束力。
三、实际损失情况
损失评估：
- 公司需对设备报废造成的实际损失进行评估，包括设备购置成本、维修费用、生产中断损失等。
- 损失评估应客观、合理，且能够提供相应的证据支持。
赔偿范围：
- 如果员工需要承担赔偿责任，赔偿范围通常限于公司因此遭受的实际损失。
- 但公司不得要求员工承担超出其过错程度的赔偿责任，也不得通过赔偿来获取额外利益。
四、法律建议
收集证据：
- 公司应收集相关证据，如设备报废的照片、视频、维修记录、员工离职时的交接记录等，以证明设备报废与员工离职之间的因果关系以及员工的过错程度。
协商解决：
- 在明确员工责任后，公司可以与员工进行协商，寻求和解或达成赔偿协议。
法律途径：
- 如果协商无果，公司可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或向人民法院提起诉讼，要求员工承担赔偿责任。
举例说明：假设员工在离职时未按照公司规定进行设备交接和关机操作，导致设备在无人看管的情况下长时间运行而报废。在这种情况下，员工可能构成重大过失，需要承担赔偿责任。公司可以收集设备报废的照片、维修记录以及员工离职时的交接记录等证据，与员工进行协商或通过法律途径解决争议。
进一步思考：在处理此类纠纷时，公司应注重证据的收集和保存，以便在争议发生时能够提供有力的支持。同时，公司也应加强员工管理和培训，提高员工的责任意识和操作技能，减少类似纠纷的发生。如果您有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。