结论：员工以996工作制为由拒绝去项目上班，这一行为涉及劳动法的多个方面，包括工作时间、加班规定以及员工的权利与义务等。作为雇主，需要综合考虑法律规定、公司政策以及员工的具体情况来妥善处理。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 从劳动法规定角度：

   • 根据我国《劳动法》及相关规定，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周工作时间不超过44小时。若公司实行996工作制，即每周工作72小时，显然超出了法定工作时间，属于违法行为。
   • 员工有权拒绝违法加班。如果公司要求员工在超出法定工作时间的情况下工作，员工可以依法拒绝，并有权向劳动监察部门投诉。

2. 从公司政策与合同角度：

   • 公司应制定合法合规的工作时间政策，并明确写入劳动合同中。如果劳动合同中未明确约定996工作制，员工有权拒绝执行。
   • 即使劳动合同中有相关约定，但如果该约定违反了法律法规的强制性规定，也是无效的。员工可以依据法律规定拒绝违法的工作安排。

3. 从员工沟通与协商角度：

   • 在处理此类问题时，公司应首先与员工进行沟通，了解员工拒绝上班的具体原因和诉求。
   • 如果员工确实因为996工作制而拒绝上班，公司可以考虑调整工作时间安排，如实行弹性工作制、轮班制等，以符合法律规定并满足员工需求。
   • 同时，公司也可以与员工协商，通过增加加班费、提供调休等方式来补偿员工的额外劳动。

4. 从法律后果角度：

   • 如果公司坚持要求员工执行违法的996工作制，并因此解雇员工或采取其他不利措施，员工有权向劳动仲裁机构申请仲裁，要求公司承担违法解除劳动合同的赔偿责任。
   • 此外，公司还可能面临劳动监察部门的处罚，包括罚款、责令改正等。

建议：

• 作为雇主，应严格遵守劳动法律法规，制定合法合规的工作时间政策，并确保劳动合同中的相关条款符合法律规定。
• 在处理员工拒绝上班的问题时，应积极与员工沟通协商，寻求双方都能接受的解决方案。
• 如果无法协商解决，应及时寻求法律援助或咨询专业律师，以避免法律风险。

如有任何进一步疑问或需要具体的法律建议，请直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律指导。