结论：在非法营运被抓且车子被扣的情况下，停车费一般应由车主承担，但具体还需根据实际情况和法律规定来判断。以下是从不同角度的详细分析：
从车辆所有权角度：
- 车辆作为车主的财产，车主有义务确保车辆的使用符合法律法规。当车辆因非法营运被扣时，由此产生的停车费，从车辆所有权的角度来看，理应由车主承担。这是因为车主是车辆的直接管理者和责任人，对车辆的使用和保管负有直接责任。
从非法营运行为角度：
- 非法营运是违法行为，驾驶员作为实施该行为的具体人员，应当对其违法行为承担相应的法律责任。然而，停车费并非直接由非法营运行为本身产生，而是由于车辆被扣而产生的附加费用。虽然驾驶员有违法行为，但这并不直接决定停车费的承担主体。不过，如果驾驶员与车主之间存在雇佣关系或租赁关系，且合同中明确约定了因违法行为产生的费用由驾驶员承担，那么驾驶员也可能需要承担部分或全部停车费。
从实际执行和法律规定角度：
- 在实际执行中，交通管理部门在扣留车辆时，通常会要求车主或驾驶员缴纳停车费。但根据相关法律法规，如《中华人民共和国道路交通安全法》等，并未明确规定停车费的具体承担主体。因此，在实际操作中，停车费的承担往往取决于交通管理部门的具体规定或车主与驾驶员之间的协商。
- 如果交通管理部门有明确规定或双方有明确约定，那么应按照规定或约定来执行。如果没有明确规定或约定，那么从公平合理的角度出发，车主作为车辆的所有者和管理者，更有可能被要求承担停车费。
特殊情况下的考虑：
- 如果车主能够证明自己对非法营运行为不知情，且没有从中获利，那么车主可能可以主张不承担或减少承担停车费。但这需要车主提供充分的证据来支持其主张。
- 如果驾驶员是未成年人或无民事行为能力人，且其非法营运行为是在车主的监护或管理下发生的，那么车主可能需要承担更多的责任，包括停车费。
建议：
- 对于车主而言，应加强对车辆的管理和监督，确保车辆的使用符合法律法规，避免非法营运等违法行为的发生。
- 对于驾驶员而言，应遵守交通法规，不从事非法营运等违法行为，以免给自己和车主带来不必要的麻烦和损失。
- 如果发生车辆被扣和停车费争议的情况，建议车主和驾驶员及时沟通协商，并咨询专业律师的意见，以便更好地维护自己的合法权益。
如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会尽我所能为你提供专业的法律服务。