核心结论：若停工留薪期确定后又发现两处骨折，可通过申请延长停工留薪期或重新鉴定停工留薪期来维护自身权益。以下是具体分析：
- 申请延长停工留薪期
- 法律依据：根据《工伤保险条例》第三十三条规定，停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。如果在原停工留薪期结束前，又发现两处骨折，这属于伤情严重或者情况特殊的情形，职工有权申请延长停工留薪期。
- 申请流程：职工应在原停工留薪期满前，向用人单位提出延长停工留薪期的书面申请，并提交相关的医疗诊断证明，如病历、检查报告等，以证明新发现的两处骨折与工伤有关且需要继续治疗和休息。用人单位同意后，报设区的市级劳动能力鉴定委员会确认。若用人单位不同意，职工也可以直接向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出确认申请。
- 重新鉴定停工留薪期
- 适用情形：如果新发现的两处骨折对工伤职工的劳动能力影响较大，导致原确定的停工留薪期明显不合理，也可以考虑重新鉴定停工留薪期。例如，原停工留薪期是按照一处骨折的较轻伤情确定的，而现在新增两处骨折，伤情明显加重，原停工留薪期无法满足治疗和康复需要。
- 申请方式：职工或其近亲属、用人单位都可以向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出重新鉴定停工留薪期的申请。申请时需要提供工伤认定决定书、初次停工留薪期鉴定结论、新的医疗诊断证明等材料。劳动能力鉴定委员会会根据职工的伤情、治疗情况等因素，重新确定停工留薪期。
注意事项：在整个过程中，要注意保留好相关的证据材料，如医疗诊断证明、工伤认定决定书、与用人单位沟通的记录等。这些证据对于申请延长或重新鉴定停工留薪期至关重要，能够支持自己的主张，确保合法权益得到保障。如果对申请流程或相关法律规定有疑问，可以直接向我咨询。