如果奶茶店因使用防腐剂被查处并决定直接关闭，仍然需要缴纳罚款。以下是详细分析：

1. 行政处罚的独立性
   行政机关对违法行为的处罚（如罚款）是基于违法行为本身作出的，与违法主体是否继续经营无关。即使奶茶店选择关闭，其违法行为已成立，行政机关仍有权依法追缴罚款。若拒不缴纳，行政机关可申请法院强制执行，包括查封、扣押财产等措施。

2. 法律责任的承担主体
   罚款的承担主体是奶茶店（作为法人或个体工商户），而非经营者个人（除非存在个人财产与公司财产混同的情况）。即使店铺注销，若行政机关在注销前已作出处罚决定，原经营者仍需以个人财产承担责任；若注销后才发现违法行为，可能需追究原经营者的个人责任。

3. 关闭店铺的流程与罚款缴纳
   若奶茶店计划关闭，需完成以下步骤：

   • 清算债务：罚款属于行政债务，需在清算程序中优先偿还。
     
   • 注销登记：需向市场监管部门提交清算报告，证明债务已清偿（包括罚款）。若未缴纳罚款，注销申请可能被驳回。
     
   • 信用影响：拒不缴纳罚款会导致企业或经营者被列入失信名单，影响未来经营或个人征信。

4. 特殊情况处理

   • 罚款减免：若因经济困难无法一次性缴纳，可向行政机关申请分期或减免（需提供证明材料）。
     
   • 行政复议/诉讼：若对处罚决定有异议，可在法定期限内申请复议或提起诉讼，但需先缴纳罚款或提供担保（根据《行政处罚法》第七十二条）。

建议行动：

1. 立即联系行政机关（如市场监管局），确认罚款金额及缴纳期限。
   
2. 评估是否申请分期缴纳或复议/诉讼，避免滞纳金累积（每日按罚款数额的3%加处）。
   
3. 若决定关闭店铺，需完成清算并缴纳罚款后再办理注销手续。
   

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