结论：一天加班超过三小时是否违法，需根据具体情况判断。在一般情况下，若未经特殊审批且超出法定限制，则可能构成违法；但在特定特殊情况下，如紧急处理、公共设施抢修等，则可能合法。

一、一般情况下的加班规定

根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后，可以延长工作时间。但延长的工作时间有严格限制：

1. 一般每日加班时间：一般每日不得超过一小时。
2. 特殊每日加班时间：在特殊原因下，且需保障劳动者身体健康的条件下，延长工作时间每日不得超过三小时，但每月累计不得超过三十六小时。

举例说明：如果一家公司因业务繁忙，要求员工每天加班四小时，且没有特殊原因或未与员工协商一致，那么这种加班行为就违反了劳动法的规定。

二、特殊情况下的加班豁免

然而，法律也考虑到了一些特殊情况，允许在这些情况下加班时间超过上述限制。根据《中华人民共和国劳动法》第四十二条的规定，以下情形不受上述加班时间的限制：

1. 紧急处理情况：发生自然灾害、事故或其他威胁劳动者生命健康和财产安全的情况，需要紧急处理的。例如，地震、洪水等自然灾害发生时，相关救援单位和人员需要加班加点进行抢险救灾工作。
2. 公共设施抢修：生产设备、交通运输线路、公共设施发生故障，影响生产和公众利益，必须及时抢修的。如城市供水管道破裂，维修人员需加班抢修以保障正常供水。
3. 其他法定情形：法律、行政法规规定的其他特殊情形，作为兜底条款以适应可能出现的其他紧急情况。

三、劳动者权益保护

面对可能的违法加班行为，劳动者应了解自己的合法权益，并采取必要措施进行保护：

1. 沟通协商：如果认为加班时间过长，首先可以尝试与用人单位沟通协商，表达自己的诉求和关切。
2. 投诉举报：若沟通无果，可以向当地劳动行政部门投诉，由劳动行政部门进行调查处理。根据《劳动保障监察条例》第二十五条，用人单位违反劳动保障法律、法规或者规章延长劳动者工作时间的，由劳动保障行政部门给予警告，责令限期改正，并可以按照受侵害的劳动者每人100元以上500元以下的标准计算，处以罚款。
3. 法律途径：在必要时，劳动者还可以选择通过劳动仲裁或诉讼等法律途径来维护自己的权益，要求用人单位支付加班工资、赔偿相应损失等。

四、加班工资的计算

如果加班行为合法，用人单位还需按照国家规定支付加班费。具体计算标准如下：

1. 平时加班（即工作日延时加班）：按不低于劳动者本人小时工资标准的150%支付加班工资。
2. 休息日加班：若不能安排补休，则按不低于劳动者本人日或小时工资标准的200%支付加班工资。
3. 法定休假日加班：按不低于劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班工资。

总结：一天加班超过三小时是否违法，需结合具体情况和法律规定来判断。在一般情况下，超时加班是违法的；但在特定的特殊情况下，如紧急处理、公共设施抢修等，超时加班可能不被视为违法。劳动者应充分了解自己的权益，并在必要时采取合法手段维护自身权益。如果你有任何关于劳动工伤的法律问题，都可以直接向我咨询。