正式员工自离跑路，赔偿问题需分情况讨论，具体如下：
- 员工自离跑路对用人单位造成损失的赔偿
根据《劳动合同法》第九十条，劳动者违反本法规定解除劳动合同，或违反劳动合同中约定的保密义务、竞业限制，给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。
- 赔偿范围：包括用人单位因员工擅自离职导致的直接经济损失（如临时招聘替代人员的费用、生产停滞损失等），但需用人单位举证证明损失与员工自离的因果关系及具体金额。
- 举证责任：用人单位需提供证据（如财务记录、招聘合同、生产日志等）证明损失实际发生且与员工行为直接相关。若无法举证，则难以获得赔偿。
- 员工自离跑路后，用人单位是否需支付经济补偿
根据《劳动合同法》第三十七条，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同；试用期内提前三日通知。若员工未履行通知义务擅自离职（即“自离跑路”），属于违法解除劳动合同，用人单位无需支付经济补偿。
- 例外情形：若用人单位存在未及时足额支付劳动报酬、未依法缴纳社保等违法行为，员工可依据《劳动合同法》第三十八条立即解除劳动合同并主张经济补偿，但需通过合法程序（如书面通知、投诉等）主张权利，而非擅自离职。
- 员工自离跑路后，工资结算问题
根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
- 自离员工的工资处理：即使员工擅自离职，用人单位仍需结算其离职前的工资，不得克扣或拖欠。若员工未办理工作交接导致用人单位损失，用人单位可另案主张赔偿，但不得以此为由拒付工资。
建议：
- 对用人单位：完善离职管理制度，要求员工履行书面通知义务；若员工擅自离职，及时固定损失证据并通过法律途径追偿。
- 对员工：避免擅自离职，否则可能承担赔偿责任且丧失经济补偿权利；若用人单位存在违法行为，应通过合法途径维权。
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