结论：在合同纠纷中，若一方未履行告知义务，而合同中已约定逾期付款利息为日万分之四，是否适用中小企业支付保障条款，需根据具体情况分析，不能直接一概而论地认为可以或不可以适用。以下从多个角度进行详细分析：
一、中小企业支付保障条款的适用条件
中小企业支付保障条款，通常是为了保障中小企业在交易中的合法权益，防止大企业利用市场优势地位拖欠中小企业款项而设立的。其适用一般需满足以下条件：
- 主体资格：申请适用的一方应为中小企业，这通常根据企业的规模、从业人员数量、营业收入等指标来确定。
- 交易性质：交易应属于正常的商业交易，且中小企业在交易中处于相对弱势地位。
- 拖欠事实：存在大企业拖欠中小企业款项的事实。
二、未履行告知义务与逾期付款利息的关系
- 未履行告知义务：如果一方在合同签订或履行过程中未履行告知义务，这可能构成违约或欺诈，但并不直接决定逾期付款利息的适用或中小企业支付保障条款的适用。未履行告知义务可能导致的法律后果是对方有权要求赔偿损失、解除合同或采取其他补救措施。
- 逾期付款利息：合同中约定的逾期付款利息日万分之四，是双方对逾期付款违约责任的约定。只要该约定不违反法律法规的强制性规定，就应被认定为有效。
三、是否适用中小企业支付保障条款的具体分析
若符合中小企业支付保障条款的适用条件：
- 如果中小企业在交易中确实处于弱势地位，且大企业存在拖欠款项的事实，那么中小企业可以依据相关法律法规或政策，申请适用中小企业支付保障条款，以保障自己的合法权益。
- 但此时，逾期付款利息的约定并不因适用中小企业支付保障条款而失效。中小企业仍可以依据合同约定要求大企业支付逾期付款利息。
若不符合中小企业支付保障条款的适用条件：
- 如果交易双方并不满足中小企业支付保障条款的适用条件，或者该条款并不适用于当前交易类型，那么中小企业就不能直接依据该条款来主张权益。
- 在这种情况下，中小企业仍可以依据合同约定要求对方支付逾期付款利息，或者通过其他法律途径来维护自己的合法权益。
四、法律建议
- 审查合同条款：首先，应仔细审查合同条款，特别是关于逾期付款利息和告知义务的约定，以明确双方的权利和义务。
- 收集证据：如果认为对方未履行告知义务或存在拖欠款项的事实，应及时收集相关证据，如合同、交易记录、沟通记录等。
- 咨询专业律师：在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和帮助。律师可以根据具体情况，分析是否适用中小企业支付保障条款，以及如何通过法律途径来维护自己的合法权益。
总结：在合同纠纷中，是否适用中小企业支付保障条款需根据具体情况分析。如果符合适用条件，中小企业可以依据该条款来主张权益；如果不符合适用条件，则可以通过其他法律途径来维护自己的合法权益。在任何情况下，都应仔细审查合同条款并收集相关证据，以便在纠纷发生时能够有力地维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。