公司擅自将劳动合同变更为培训协议，这一行为通常是违法的。以下从几个角度进行详细分析：
一、劳动合同变更的法定原则
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则，并且不得违反法律、行政法规的规定。这意味着，任何一方都不能单方面擅自变更劳动合同的内容，包括将劳动合同变更为培训协议。
二、擅自变更劳动合同的法律后果
无效变更：如果公司未经员工同意，擅自将劳动合同变更为培训协议，这种变更行为是无效的。员工有权拒绝执行变更后的协议，并要求公司继续履行原劳动合同。
违法解除风险：如果公司以员工拒绝变更劳动合同为由解除劳动合同，这可能构成违法解除。根据《劳动合同法》的规定，公司违法解除劳动合同的，应当向员工支付赔偿金。
劳动争议：擅自变更劳动合同还可能引发劳动争议，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求公司承担相应的法律责任。
三、培训协议与劳动合同的关系
培训协议通常是劳动合同的补充协议，用于约定员工参加培训的相关事宜，如培训内容、培训时间、培训费用等。然而，培训协议并不能替代劳动合同，也不能改变劳动合同的基本性质和内容。如果公司试图通过签订培训协议来规避劳动合同的法律义务，这是不合法的。
四、员工应对策略
拒绝变更：如果公司提出擅自变更劳动合同的要求，员工有权拒绝，并要求公司继续履行原劳动合同。
收集证据：员工应收集相关证据，如劳动合同、培训协议、公司通知等，以备不时之需。
申请仲裁：如果公司坚持擅自变更劳动合同，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。
五、特殊情况说明
当然，也存在一些特殊情况。例如，如果双方在原劳动合同中已经明确约定了公司有权根据业务需要调整员工的工作岗位或工作内容，并且这种调整是合理的、不违反法律规定的，那么公司可能在一定程度上有权对劳动合同进行变更。但是，这种变更仍然需要遵循平等自愿、协商一致的原则，并且不能损害员工的合法权益。另外，如果培训协议是作为劳动合同的附件或补充协议，且双方已经就培训事宜达成一致意见，并明确约定了培训后的工作安排、薪资待遇等关键条款，且这些条款不违反法律法规的强制性规定，那么这种变更可能是合法的。但即便如此，公司也应当确保员工在签订培训协议前充分了解其内容，并自愿接受。
总结与建议：公司擅自将劳动合同变更为培训协议通常是违法的。员工在面对这种情况时，应坚决拒绝并收集相关证据以维护自己的合法权益。如果公司坚持擅自变更劳动合同，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。