当肇事者不是车主时，受害者仍然可以起诉肇事者以维护自身权益，同时根据具体情况，车主也可能成为共同被告或承担相应责任。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、责任主体认定
肇事者责任：
- 无论肇事者是否为车主，只要其驾驶车辆时发生了交通事故并造成损害，且属于该机动车一方责任，肇事者就应当承担赔偿责任。这是基于《中华人民共和国民法典》中关于侵权责任的规定。
车主责任：
- 一般情况：如果车主对事故的发生没有过错，比如车辆被合法借用或租赁，且车主已尽到合理的审查义务（如确认驾驶者有合法驾照），则车主通常不承担赔偿责任。
- 特殊情况：如果车主存在过错，如明知车辆有故障仍出借、未妥善保管车辆导致被未经允许驾驶等，车主也可能需要承担相应的赔偿责任。这同样依据《中华人民共和国民法典》的相关规定。
二、起诉流程与要点
准备起诉材料：
- 受害者需要准备起诉状，明确被告（肇事者，必要时可包括车主）、诉讼请求（如赔偿医疗费、误工费、车辆维修费等）和事实理由。
- 同时，需要收集并整理相关证据，如交通事故责任认定书、现场照片、医疗费用清单、车辆维修发票等，以证明事故发生、损失情况及肇事者的侵权行为。
确定被告信息：
- 明确肇事者的基本信息，如姓名、身份证号、联系方式等。如果车主也可能需要承担责任，同样需要收集车主的相关信息。
提交起诉状：
- 将起诉材料及证据提交至有管辖权的法院，通常为事故发生地或被告住所地法院。
法院受理与审理：
- 法院将在规定时间内受理并审理案件。双方可以进行举证、质证等程序，法院将根据事实和法律作出判决。
法院判决与执行：
- 如果法院判决肇事者（和/或车主）承担赔偿责任，肇事者（和/或车主）需按判决结果进行赔偿。如果拒不履行，受害者可以申请法院强制执行。
三、特殊情况处理
雇佣关系：
- 如果肇事者与车主为雇佣关系，且肇事者在执行工作任务时发生事故，车主通常需要承担赔偿责任。但如肇事者存在故意或重大过失，车主在承担对外赔偿责任后，可以向肇事者追偿。
车辆被盗抢或未经允许驾驶：
- 如果车辆被盗抢或未经允许被驾驶，且发生事故，由盗窃人、抢劫人或抢夺人（或未经允许的驾驶者）承担赔偿责任。车主在无过错的情况下不承担赔偿责任，但保险公司可能在机动车强制保险责任限额范围内垫付抢救费用，并有权向责任人追偿。
四、法律建议
- 及时报警并保留证据：发生事故后，应立即报警并等待交警勘查现场、出具交通事故责任认定书。同时，通过拍照、录像等方式记录事故现场，以备后续处理。
- 咨询专业律师：在处理此类复杂交通事故时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。律师可以根据具体情况分析责任主体、赔偿项目及金额等，并协助准备起诉材料、参与诉讼等。
总结来说，当肇事者不是车主时，受害者仍然可以起诉肇事者以维护自身权益。同时，根据具体情况，车主也可能成为共同被告或承担相应责任。在处理此类事故时，应确保准备充分的证据材料，并遵循法律程序进行。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。